282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0918 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  49.13 
 
 		 230 aa  224  8e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 252 aa  105  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  29.61 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  29.61 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  26.32 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  27.4 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  28.33 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  29.36 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  30.13 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  28.76 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  28.57 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  27.85 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  26.52 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  28.33 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  25.58 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  27.35 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  27.78 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  28.44 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  27.96 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 410 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  25.65 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  27.14 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  27.14 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 300 aa  55.1  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  28.09 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  26.32 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 158 aa  53.5  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4073  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 141 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 137 aa  53.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 115 aa  52.4  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 115 aa  52.8  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 115 aa  52.8  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  42.31 
 
 		 459 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  25.23 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  27.31 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  25.76 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 118 aa  52  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  34.62 
 
 		 117 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  22.46 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  32.91 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1627  transcriptional regulator, XRE family  36.89 
 
 		 135 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 137 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 152 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  25.51 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  25.34 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  26.18 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 380 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 118 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  38.6 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  26.81 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  29.7 
 
 		 117 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  37.74 
 
 		 108 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26.87 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  24.89 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 108 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 145 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  23.83 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  26.58 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  47.17 
 
 		 383 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2653  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 110 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200481  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  28.76 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0548  prophage LambdaSa1, repressor protein, putative  25.94 
 
 		 265 aa  49.3  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000127482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  35.37 
 
 		 149 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  33.75 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 142 aa  49.3  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 139 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 152 aa  48.9  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  25.85 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  24.28 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  26.18 
 
 		 256 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  27.96 
 
 		 144 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0803  hypothetical protein  24.51 
 
 		 255 aa  48.5  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0115457  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  35.37 
 
 		 196 aa  48.5  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 176 aa  48.5  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  39.62 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 134 aa  48.5  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  35.9 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 135 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  24.5 
 
 		 163 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  42.59 
 
 		 123 aa  48.5  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 133 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  23.79 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  26.39 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  34.15 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  23.72 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  23.67 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>