50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1395 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1395  putative phage repressor  100 
 
 
239 aa  494  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  35.14 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  34.23 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  35.63 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  35.63 
 
 
247 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  31.62 
 
 
215 aa  62  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  34.48 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  30.58 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  37.93 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  30.53 
 
 
212 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  25.99 
 
 
264 aa  52.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  25.99 
 
 
264 aa  52.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  32.18 
 
 
251 aa  52  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 
219 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  30.39 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  25.53 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  34.48 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  32.97 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  35.37 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  30.83 
 
 
144 aa  49.3  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  25.67 
 
 
193 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  33.33 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  31.11 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  27.47 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  30.95 
 
 
230 aa  46.2  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  26.09 
 
 
205 aa  45.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  31.11 
 
 
225 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  30.95 
 
 
233 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  30 
 
 
229 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  31.03 
 
 
247 aa  45.4  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  32.63 
 
 
233 aa  45.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  30.95 
 
 
233 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  30.95 
 
 
233 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  28.89 
 
 
229 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  34.41 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  31.4 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  28.92 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  29.76 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  24.75 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  25.27 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  29.63 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  30.95 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  31.4 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  30.93 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  30.85 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  29.55 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  27.19 
 
 
265 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  27.78 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  27.91 
 
 
270 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>