42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0805 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0805  conserved hypothetical protein, putative peptidase S24  100 
 
 
211 aa  427  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  57.21 
 
 
209 aa  241  5e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  36.19 
 
 
219 aa  112  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  31.88 
 
 
219 aa  96.7  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  31.25 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  31.25 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  32.08 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  25.56 
 
 
229 aa  61.6  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  26.7 
 
 
219 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  24.27 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  28.74 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  32.1 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  32.61 
 
 
233 aa  50.1  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  29.6 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  22.93 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  31.96 
 
 
205 aa  49.7  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  24.73 
 
 
216 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  22.03 
 
 
236 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  26.57 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  23.47 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  30.38 
 
 
243 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  32.94 
 
 
247 aa  46.2  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  21.8 
 
 
219 aa  45.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  31.11 
 
 
247 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  29.23 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  23.48 
 
 
331 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  23.24 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  25.61 
 
 
273 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  27.92 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  26.64 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  32.53 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  26.56 
 
 
283 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0804  hypothetical protein  36.51 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00564078  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  24.03 
 
 
229 aa  42.7  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0548  prophage LambdaSa1, repressor protein, putative  31.33 
 
 
265 aa  42.7  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000127482  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  28.75 
 
 
233 aa  42.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  22.33 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  27.01 
 
 
269 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  32.53 
 
 
244 aa  42  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  25.55 
 
 
205 aa  41.6  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  32.1 
 
 
238 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  25 
 
 
230 aa  41.6  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>