17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0804 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0804  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00564078  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1859  CI repressor  47.06 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00836044  normal  0.0132709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04120  transcriptional regulator  40 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3705  CI repressor  38.03 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4133  transcriptional regulator-related protein  45 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1732  bacteriophage CI repressor  45 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000144956  normal  0.557146 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  40.58 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  42.86 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  28 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  41.86 
 
 		 209 aa  45.4  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  33.33 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1427  CI repressor  32.76 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  29.21 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0805  conserved hypothetical protein, putative peptidase S24  36.51 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1615  hypothetical protein  31.51 
 
 		 174 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  33.93 
 
 		 235 aa  42  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  29.21 
 
 		 232 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>