23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1615 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1615  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  343  8.999999999999999e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1427  CI repressor  40.91 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04120  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 129 aa  52.4  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  31.82 
 
 		 284 aa  51.6  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3154  CI repressor  30.86 
 
 		 285 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3705  CI repressor  40 
 
 		 126 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1859  CI repressor  40.91 
 
 		 128 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00836044  normal  0.0132709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4133  transcriptional regulator-related protein  37.29 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1732  bacteriophage CI repressor  37.29 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000144956  normal  0.557146 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1342  bacteriophage CI repressor  30.99 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453655  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0700  bacteriophage CI repressor  31.75 
 
 		 255 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2082  CI repressor  33.85 
 
 		 287 aa  45.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1269  bacteriophage CI repressor  31.75 
 
 		 233 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0911  putative bacteriophage CI repressor protein  30 
 
 		 189 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000321718  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2793  CI repressor  30 
 
 		 189 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.0967608 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  27.38 
 
 		 235 aa  44.7  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00833  hypothetical protein  30 
 
 		 189 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00817  Repressor protein  30 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.392805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1837  CI repressor  31.08 
 
 		 270 aa  44.3  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05009  hypothetical protein  30.99 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0804  hypothetical protein  31.51 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00564078  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0877  CI repressor  35 
 
 		 288 aa  42  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.277312  normal  0.131119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3513  bacteriophage CI repressor  23.3 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0780259  normal  0.0343315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>