24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04120 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_04120  transcriptional regulator  100 
 
 
129 aa  254  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4133  transcriptional regulator-related protein  43.09 
 
 
125 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3705  CI repressor  44.17 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126263  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1732  bacteriophage CI repressor  43.44 
 
 
125 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000144956  normal  0.557146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1859  CI repressor  42.28 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00836044  normal  0.0132709 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0804  hypothetical protein  40 
 
 
236 aa  56.6  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00564078  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1615  hypothetical protein  38.6 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1230  hypothetical protein  30.7 
 
 
179 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.384901  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0877  CI repressor  30.61 
 
 
288 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.277312  normal  0.131119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  32.91 
 
 
284 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2082  CI repressor  44.23 
 
 
287 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  38.89 
 
 
236 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1837  CI repressor  43.4 
 
 
270 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1427  CI repressor  33.33 
 
 
240 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2793  CI repressor  35.53 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.0967608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00833  hypothetical protein  35.53 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00817  Repressor protein  35.53 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.392805  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0911  putative bacteriophage CI repressor protein  35.53 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000321718  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1342  bacteriophage CI repressor  44.23 
 
 
198 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453655  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  31.48 
 
 
209 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3154  CI repressor  40.38 
 
 
285 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  29.41 
 
 
230 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  37.04 
 
 
229 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  33.33 
 
 
235 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>