26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0883 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0883  CI repressor  100 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2793  CI repressor  43.33 
 
 		 189 aa  170  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.0967608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00833  hypothetical protein  41.67 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0911  putative bacteriophage CI repressor protein  41.11 
 
 		 189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000321718  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00817  Repressor protein  41.81 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.392805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1342  bacteriophage CI repressor  41.14 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453655  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2082  CI repressor  37.3 
 
 		 287 aa  138  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0877  CI repressor  35.52 
 
 		 288 aa  134  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.277312  normal  0.131119 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1837  CI repressor  36.31 
 
 		 270 aa  128  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3154  CI repressor  32.63 
 
 		 285 aa  117  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3505  repressor protein  39.39 
 
 		 137 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.07388e-18 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3513  bacteriophage CI repressor  26.84 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0780259  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05009  hypothetical protein  29.8 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3065  phage repressor protein cI  32.99 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2950  repressor protein  38.82 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132196  hitchhiker  1.92904e-20 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0700  bacteriophage CI repressor  23.83 
 
 		 255 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0506  hypothetical protein, putative phage gene  26.13 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0589697  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1076  putative bacteriophage CI repressor protein  24.51 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  24.42 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1269  bacteriophage CI repressor  28.8 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  24.02 
 
 		 219 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  21.18 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1586  putative PAS/PAC sensor protein  37.29 
 
 		 541 aa  42  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.822014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  28 
 
 		 209 aa  42  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0420  CI repressor  29.69 
 
 		 116 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2707  putative PAS/PAC sensor protein  33.9 
 
 		 640 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>