22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3513 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3513  bacteriophage CI repressor  100 
 
 
195 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0780259  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0911  putative bacteriophage CI repressor protein  33.91 
 
 
189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000321718  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00817  Repressor protein  33.33 
 
 
187 aa  128  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.392805  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00833  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2793  CI repressor  32.76 
 
 
189 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.0967608 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1342  bacteriophage CI repressor  33.73 
 
 
198 aa  118  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453655  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2082  CI repressor  31.84 
 
 
287 aa  111  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1837  CI repressor  31.28 
 
 
270 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0883  CI repressor  26.84 
 
 
187 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0877  CI repressor  29.55 
 
 
288 aa  88.2  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.277312  normal  0.131119 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3505  repressor protein  37.12 
 
 
137 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.07388e-18 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3154  CI repressor  26.92 
 
 
285 aa  81.3  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05009  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  62  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3065  phage repressor protein cI  27.88 
 
 
134 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0506  hypothetical protein, putative phage gene  29.57 
 
 
147 aa  56.6  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0589697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2950  repressor protein  35.82 
 
 
95 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132196  hitchhiker  1.92904e-20 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1076  putative bacteriophage CI repressor protein  24.62 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  21.61 
 
 
236 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  37.7 
 
 
247 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  33.33 
 
 
247 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  26.92 
 
 
229 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1615  hypothetical protein  23.3 
 
 
174 aa  41.6  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>