27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0877 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0877  CI repressor  100 
 
 		 288 aa  577  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.277312  normal  0.131119 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2082  CI repressor  56.69 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1837  CI repressor  57.99 
 
 		 270 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3154  CI repressor  51.64 
 
 		 285 aa  288  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1342  bacteriophage CI repressor  35 
 
 		 198 aa  136  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453655  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2793  CI repressor  35.52 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.0967608 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0883  CI repressor  35.52 
 
 		 187 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0911  putative bacteriophage CI repressor protein  34.97 
 
 		 189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000321718  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00833  hypothetical protein  34.97 
 
 		 189 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00817  Repressor protein  34.43 
 
 		 187 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.392805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3513  bacteriophage CI repressor  29.55 
 
 		 195 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0780259  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05009  hypothetical protein  30.26 
 
 		 208 aa  87  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3065  phage repressor protein cI  31.2 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1269  bacteriophage CI repressor  28.44 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3505  repressor protein  30.22 
 
 		 137 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.07388e-18 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0700  bacteriophage CI repressor  29.9 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1010  probable phage regulatory protein CI  22.11 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1076  putative bacteriophage CI repressor protein  25.12 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0506  hypothetical protein, putative phage gene  29.41 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0589697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2950  repressor protein  27.78 
 
 		 95 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132196  hitchhiker  1.92904e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04120  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 129 aa  49.7  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3705  CI repressor  38.1 
 
 		 126 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  33.33 
 
 		 236 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  34.92 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4133  transcriptional regulator-related protein  33.33 
 
 		 125 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1732  bacteriophage CI repressor  33.33 
 
 		 125 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000144956  normal  0.557146 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  29.12 
 
 		 229 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>