19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3065 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3065  phage repressor protein cI  100 
 
 		 134 aa  270  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0883  CI repressor  32.99 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0877  CI repressor  31.2 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.277312  normal  0.131119 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1837  CI repressor  36.26 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2082  CI repressor  33.01 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0506  hypothetical protein, putative phage gene  30.19 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0589697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3513  bacteriophage CI repressor  27.88 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0780259  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0911  putative bacteriophage CI repressor protein  32.99 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000321718  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1342  bacteriophage CI repressor  27.08 
 
 		 198 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453655  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00833  hypothetical protein  31.96 
 
 		 189 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00817  Repressor protein  31.96 
 
 		 187 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.392805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2793  CI repressor  26.04 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.0967608 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3154  CI repressor  27.1 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05009  hypothetical protein  29.81 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1010  probable phage regulatory protein CI  37.86 
 
 		 318 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3505  repressor protein  33.02 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.07388e-18 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1076  putative bacteriophage CI repressor protein  29.7 
 
 		 215 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0700  bacteriophage CI repressor  24.58 
 
 		 255 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2950  repressor protein  21.69 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132196  hitchhiker  1.92904e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>