19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0700 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0700  bacteriophage CI repressor  100 
 
 		 255 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1269  bacteriophage CI repressor  78.11 
 
 		 233 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05009  hypothetical protein  27.19 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1837  CI repressor  25.12 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0877  CI repressor  29.9 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.277312  normal  0.131119 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2082  CI repressor  26.54 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3154  CI repressor  23.79 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1010  probable phage regulatory protein CI  24.34 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1342  bacteriophage CI repressor  23.96 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453655  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00833  hypothetical protein  24.41 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00817  Repressor protein  24.41 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.392805  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1076  putative bacteriophage CI repressor protein  22.34 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0911  putative bacteriophage CI repressor protein  24.41 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000321718  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2793  CI repressor  19.9 
 
 		 189 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.0967608 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0883  CI repressor  23.83 
 
 		 187 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3065  phage repressor protein cI  24.58 
 
 		 134 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1615  hypothetical protein  31.75 
 
 		 174 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1732  bacteriophage CI repressor  36.67 
 
 		 125 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000144956  normal  0.557146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3705  CI repressor  32.79 
 
 		 126 aa  42  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>