19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1269 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1269  bacteriophage CI repressor  100 
 
 
233 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0700  bacteriophage CI repressor  78.11 
 
 
255 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05009  hypothetical protein  26.42 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1837  CI repressor  25.43 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0877  CI repressor  28.44 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.277312  normal  0.131119 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2082  CI repressor  26.77 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3154  CI repressor  25.33 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2793  CI repressor  23.79 
 
 
189 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.0967608 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1010  probable phage regulatory protein CI  36.84 
 
 
318 aa  58.9  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00833  hypothetical protein  23.79 
 
 
189 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0911  putative bacteriophage CI repressor protein  23.79 
 
 
189 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000321718  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00817  Repressor protein  23.79 
 
 
187 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.392805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1342  bacteriophage CI repressor  24.87 
 
 
198 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453655  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1076  putative bacteriophage CI repressor protein  21.28 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  22.93 
 
 
235 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0883  CI repressor  28.8 
 
 
187 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1615  hypothetical protein  31.75 
 
 
174 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1732  bacteriophage CI repressor  32.26 
 
 
125 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000144956  normal  0.557146 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0506  hypothetical protein, putative phage gene  23.76 
 
 
147 aa  43.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0589697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>