25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05009 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05009  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  420  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1076  putative bacteriophage CI repressor protein  40.38 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0506  hypothetical protein, putative phage gene  47.3 
 
 		 147 aa  122  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0589697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1010  probable phage regulatory protein CI  30.3 
 
 		 318 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2082  CI repressor  31.41 
 
 		 287 aa  93.6  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3154  CI repressor  32.02 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1837  CI repressor  31.09 
 
 		 270 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00833  hypothetical protein  28.19 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0877  CI repressor  30.26 
 
 		 288 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.277312  normal  0.131119 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00817  Repressor protein  28.19 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.392805  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0911  putative bacteriophage CI repressor protein  27.66 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000321718  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1269  bacteriophage CI repressor  26.42 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0883  CI repressor  29.8 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0700  bacteriophage CI repressor  27.19 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2793  CI repressor  28.19 
 
 		 189 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.0967608 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1342  bacteriophage CI repressor  25.51 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453655  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3513  bacteriophage CI repressor  25 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0780259  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3065  phage repressor protein cI  29.81 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  24.43 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3505  repressor protein  24.32 
 
 		 137 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.07388e-18 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  22.97 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1427  CI repressor  32.84 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1615  hypothetical protein  30.99 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2950  repressor protein  29.55 
 
 		 95 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132196  hitchhiker  1.92904e-20 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 240 aa  41.6  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>