17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2950 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2950  repressor protein  100 
 
 		 95 aa  196  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132196  hitchhiker  1.92904e-20 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2793  CI repressor  34.94 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.0967608 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00817  Repressor protein  33.73 
 
 		 187 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.392805  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00833  hypothetical protein  33.73 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0911  putative bacteriophage CI repressor protein  32.18 
 
 		 189 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000321718  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0883  CI repressor  38.82 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0506  hypothetical protein, putative phage gene  36.26 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0589697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3513  bacteriophage CI repressor  35.82 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0780259  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1342  bacteriophage CI repressor  27.27 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453655  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3505  repressor protein  34.72 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.07388e-18 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0877  CI repressor  27.78 
 
 		 288 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.277312  normal  0.131119 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2082  CI repressor  27.71 
 
 		 287 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1076  putative bacteriophage CI repressor protein  35.94 
 
 		 215 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1010  probable phage regulatory protein CI  31.94 
 
 		 318 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1837  CI repressor  24.1 
 
 		 270 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05009  hypothetical protein  29.55 
 
 		 208 aa  42.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3065  phage repressor protein cI  21.69 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>