15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1010 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1010  probable phage regulatory protein CI  100 
 
 		 318 aa  655    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1076  putative bacteriophage CI repressor protein  49.35 
 
 		 215 aa  225  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05009  hypothetical protein  30.3 
 
 		 208 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0506  hypothetical protein, putative phage gene  40.65 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0589697  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0877  CI repressor  22.11 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.277312  normal  0.131119 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0700  bacteriophage CI repressor  24.34 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1269  bacteriophage CI repressor  36.84 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3065  phage repressor protein cI  37.86 
 
 		 134 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3154  CI repressor  20.75 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  32.91 
 
 		 243 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0911  putative bacteriophage CI repressor protein  26.36 
 
 		 189 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000321718  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00817  Repressor protein  26.36 
 
 		 187 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.392805  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00833  hypothetical protein  26.36 
 
 		 189 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2950  repressor protein  31.94 
 
 		 95 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132196  hitchhiker  1.92904e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3505  repressor protein  36.51 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.07388e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>