159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0163 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 141 aa  291  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  42.67 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  42.67 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4546  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000650042  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  38.6 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  33.73 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  33.73 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0198  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  39.73 
 
 		 247 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  39.73 
 
 		 247 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  44.07 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1626  helix-turn-helix domain protein  34.72 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.365666 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  29.91 
 
 		 224 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  42.25 
 
 		 219 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  33.33 
 
 		 248 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3519  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 196 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 223 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  40.35 
 
 		 245 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  35.38 
 
 		 216 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  33.33 
 
 		 216 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 151 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 196 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1419  Cro/CI family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 240 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0092  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  41.18 
 
 		 316 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  38.81 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1732  bacteriophage CI repressor  23.2 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000144956  normal  0.557146 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  38.81 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  36.51 
 
 		 459 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  38.81 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  31.67 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1019  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  48.94 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  33.33 
 
 		 230 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1425  transciptional regulator  43.75 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.132768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 321 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  26.45 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3705  CI repressor  22.69 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0218  hypothetical protein  29.76 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.201268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 208 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  32.43 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  47.37 
 
 		 64 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 301 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 197 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  40.35 
 
 		 421 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 145 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0219  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  36.76 
 
 		 324 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.855188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 432 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  46.81 
 
 		 79 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1373  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 175 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 174 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4875  HTH-type transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256136  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 202 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  32.43 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 268 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 142 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  40.35 
 
 		 421 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>