32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1373 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1373  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  358  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  48.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  42.11 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  35 
 
 		 113 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  38.18 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1070  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  27.52 
 
 		 111 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1067  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  27.52 
 
 		 111 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.745753  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0505  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  27.52 
 
 		 111 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.451167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  35 
 
 		 113 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 245 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 123 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 245 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  32.58 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  39.66 
 
 		 125 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  39.66 
 
 		 125 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27070  Helix-turn-helix protein  39.58 
 
 		 295 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  39.66 
 
 		 125 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  39.66 
 
 		 125 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  39.66 
 
 		 125 aa  42  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  39.66 
 
 		 125 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  39.66 
 
 		 125 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  39.66 
 
 		 125 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 200 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 199 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 321 aa  41.2  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 139 aa  40.8  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>