222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0703 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
84 aa  168  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  51.72 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0279  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00143869  normal  0.616249 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 
67 aa  53.9  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3464  hypothetical protein  43.4 
 
 
82 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3458  transcriptional regulator  43.4 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1603  DNA-binding protein  37.29 
 
 
62 aa  52  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00182563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2210  putative DNA-binding protein  45.61 
 
 
61 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0917  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
78 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  47.46 
 
 
69 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0466  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
69 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000580829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  38.98 
 
 
64 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  33.87 
 
 
67 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  40.98 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  33.87 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  40.98 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  40.98 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  39.34 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  40.98 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  36.51 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  36.84 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  34.92 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  41.82 
 
 
352 aa  47.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
67 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2365  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 
63 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.729391 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
63 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
83 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
66 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  36.21 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  36.84 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  36.84 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
77 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  36.84 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 
432 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  39.34 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 
69 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  36.84 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  42.37 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0737  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  39.34 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  35.59 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  39.34 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  35.59 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  39.34 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  36.84 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0505  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  34.38 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.451167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1067  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  34.38 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.745753  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1070  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  34.38 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  32.79 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  30.65 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 
224 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
490 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 
490 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
72 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  39.34 
 
 
65 aa  44.3  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  29.51 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  33.9 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  35 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
73 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  32.2 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  32 
 
 
142 aa  44.3  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  36.36 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  32 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  29.41 
 
 
377 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  28.33 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
72 aa  43.5  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  33.33 
 
 
66 aa  42.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  33.33 
 
 
66 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>