More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1419 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1419  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  69.01 
 
 		 173 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 174 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  42.42 
 
 		 245 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 248 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 98 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  45.16 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 224 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  36.78 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  37.36 
 
 		 215 aa  51.2  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 219 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  42.11 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06770  predicted transcriptional regulator  35.48 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 180 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 227 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7158  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776523  normal  0.018417 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  37.1 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 300 aa  50.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 227 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 219 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 352 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  41.38 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  41.94 
 
 		 308 aa  48.5  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3389  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14531  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  31.45 
 
 		 260 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 256 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  46.03 
 
 		 255 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 184 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0534  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000443779  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  44.07 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  32.05 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.82 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  31.45 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  39.47 
 
 		 475 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3387  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  37.65 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  36.46 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0533  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  39.71 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  32.11 
 
 		 333 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 474 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  32.11 
 
 		 333 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  38.03 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  34.94 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 234 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  33.02 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06760  Helix-turn-helix protein  40.35 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3164  helix-turn-helix domain-containing protein  36.23 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  38.03 
 
 		 199 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  31.17 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  31.17 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 404 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  31.17 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  31.17 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  31.17 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  27.94 
 
 		 482 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 203 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>