225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1606 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  87.62 
 
 		 404 aa  712    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  80.69 
 
 		 403 aa  654    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  82.18 
 
 		 403 aa  673    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  79.95 
 
 		 403 aa  652    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  82.18 
 
 		 403 aa  673    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  82.18 
 
 		 404 aa  669    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  82.18 
 
 		 403 aa  674    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  82.18 
 
 		 403 aa  673    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  82.18 
 
 		 403 aa  673    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 404 aa  813    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  26.74 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3542  helix-turn-helix domain-containing protein  42.62 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  0.855489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9326  putative transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  49.15 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  40.79 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  33.04 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  50.75 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  50.75 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  50.75 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  50.75 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  50.75 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  50.75 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  43.37 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  43.37 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  44.07 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  50.75 
 
 		 181 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1434  helix-turn-helix domain-containing protein  40.26 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.673914  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  34.41 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 232 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 220 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5721  hypothetical protein  44.26 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 191 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 191 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 191 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  33.04 
 
 		 255 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  43.04 
 
 		 179 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  34.02 
 
 		 182 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 69 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 179 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 196 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 184 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 224 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 198 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0422  transcriptional regulator  40.85 
 
 		 146 aa  51.2  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 225 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 176 aa  50.4  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  51.85 
 
 		 180 aa  50.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  46.03 
 
 		 196 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 188 aa  50.4  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  40.91 
 
 		 178 aa  50.4  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 423 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0316  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.827782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 199 aa  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 107 aa  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 179 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 199 aa  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3127  helix-turn-helix domain protein  34.78 
 
 		 434 aa  49.7  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.641093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  37.84 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 179 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  33.61 
 
 		 255 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 191 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  52.83 
 
 		 179 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  39.13 
 
 		 200 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 198 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  43.94 
 
 		 179 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1934  DNA-binding protein  43.94 
 
 		 179 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2224  helix-turn-helix domain protein  36.36 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.163485  hitchhiker  0.00213028 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0095  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 193 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  35.35 
 
 		 188 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  35.44 
 
 		 210 aa  47.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  42.59 
 
 		 215 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 187 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 179 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  32.43 
 
 		 475 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 209 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  31.91 
 
 		 152 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 201 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  29 
 
 		 199 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 178 aa  47  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 186 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 		 201 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  42.19 
 
 		 144 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 188 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 77 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  31.91 
 
 		 186 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  31.91 
 
 		 186 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 236 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  31.91 
 
 		 186 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 197 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>