228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B3595 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  78.22 
 
 
403 aa  635    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  100 
 
 
404 aa  811    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  79.46 
 
 
403 aa  647    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  79.46 
 
 
403 aa  645    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  79.46 
 
 
403 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  79.46 
 
 
403 aa  647    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  79.46 
 
 
403 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  87.62 
 
 
404 aa  712    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  77.72 
 
 
403 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  77.97 
 
 
404 aa  634  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  27.11 
 
 
435 aa  83.2  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  43.42 
 
 
436 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  36.52 
 
 
256 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3542  helix-turn-helix domain-containing protein  42.62 
 
 
442 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  0.855489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9326  putative transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 
452 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607046  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 
179 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 
192 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
179 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  49.28 
 
 
181 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 
432 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  49.28 
 
 
181 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  49.28 
 
 
181 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
181 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  49.28 
 
 
181 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
181 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  49.28 
 
 
181 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  49.28 
 
 
181 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  49.28 
 
 
181 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  25.53 
 
 
436 aa  59.7  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  49.28 
 
 
181 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  32.35 
 
 
232 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  39.44 
 
 
430 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  40.7 
 
 
220 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 
487 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1434  helix-turn-helix domain-containing protein  36.11 
 
 
433 aa  56.6  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.673914  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 
201 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  34.04 
 
 
292 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 
224 aa  53.9  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  33.05 
 
 
287 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  29.57 
 
 
252 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  33.04 
 
 
255 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 
300 aa  53.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  35.79 
 
 
187 aa  53.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  32.98 
 
 
292 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  36.7 
 
 
176 aa  52.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  36.7 
 
 
188 aa  52.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5721  hypothetical protein  40 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380907  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 
179 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 
191 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 
191 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 
191 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  40.26 
 
 
196 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 
288 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  39.08 
 
 
179 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 
178 aa  50.8  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  26.95 
 
 
421 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 
182 aa  50.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0316  XRE family transcriptional regulator  26.21 
 
 
299 aa  50.8  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.827782  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  26.95 
 
 
421 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 
201 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 
422 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 
69 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  28.78 
 
 
294 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  28.78 
 
 
294 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 
188 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  28.78 
 
 
294 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  31.3 
 
 
255 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 
180 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1934  DNA-binding protein  33.61 
 
 
179 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
201 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 
192 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
199 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 
192 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 
199 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  28.72 
 
 
201 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
193 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 
193 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  34.74 
 
 
198 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 
204 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  29.79 
 
 
225 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  28.72 
 
 
201 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  26.5 
 
 
192 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  28.78 
 
 
294 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
77 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  36 
 
 
285 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 
187 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 
191 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 
198 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  42.65 
 
 
179 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 
199 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  35 
 
 
285 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  29.79 
 
 
294 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  37.66 
 
 
197 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  29.79 
 
 
294 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
184 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  33.94 
 
 
184 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
179 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  32.29 
 
 
200 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
187 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  37.31 
 
 
236 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>