204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A1861 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  79.95 
 
 		 404 aa  652    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  96.77 
 
 		 403 aa  791    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  94.29 
 
 		 403 aa  763    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  94.29 
 
 		 403 aa  763    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  94.54 
 
 		 403 aa  764    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  100 
 
 		 403 aa  810    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  91.58 
 
 		 404 aa  741    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  94.29 
 
 		 403 aa  763    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  94.54 
 
 		 403 aa  763    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  77.72 
 
 		 404 aa  634  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  26.71 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 252 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  27.52 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3542  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  0.855489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  39.19 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  43.08 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9326  putative transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  34.19 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  45.07 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  45.07 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1434  helix-turn-helix domain-containing protein  45.9 
 
 		 433 aa  57  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.673914  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 487 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  32.76 
 
 		 255 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 196 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 232 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 192 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 179 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 179 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5721  hypothetical protein  44.26 
 
 		 431 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 191 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 198 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 191 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  35.06 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 191 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 201 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  28.19 
 
 		 197 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 199 aa  50.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 224 aa  50.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  46.03 
 
 		 196 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  42.86 
 
 		 215 aa  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 528 aa  50.1  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 199 aa  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0422  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 146 aa  49.7  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 255 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3127  helix-turn-helix domain protein  38.33 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.641093  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 180 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 182 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0155  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 115 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1770  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 173 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 211 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  40.62 
 
 		 196 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 220 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  39.06 
 
 		 263 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 199 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 201 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  51.92 
 
 		 179 aa  47.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 191 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 184 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 205 aa  47.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 77 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  48.08 
 
 		 188 aa  47.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 176 aa  47.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 201 aa  47  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 69 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  28.15 
 
 		 294 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  28.15 
 
 		 294 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  28.15 
 
 		 294 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 181 aa  46.2  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  49.09 
 
 		 179 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  32.26 
 
 		 212 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  28.15 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 187 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  41.67 
 
 		 229 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  27.73 
 
 		 192 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 190 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 225 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 201 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  32.65 
 
 		 141 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0665  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  38.46 
 
 		 200 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 193 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 300 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1184  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 73 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410956  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 204 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  45.1 
 
 		 178 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  35.82 
 
 		 206 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  48 
 
 		 193 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>