33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3542 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3542  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 442 aa  863    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  0.855489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9326  putative transcriptional regulator, XRE family  58.2 
 
 		 452 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  38.29 
 
 		 487 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 432 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  31.49 
 
 		 430 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2224  helix-turn-helix domain protein  36.11 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.163485  hitchhiker  0.00213028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3127  helix-turn-helix domain protein  32.36 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.641093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5721  hypothetical protein  41.57 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5720  hypothetical protein  26.7 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0172  helix-turn-helix domain-containing protein  26.82 
 
 		 313 aa  53.5  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 422 aa  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0397  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.32 
 
 		 475 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264481  normal  0.0251152 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3185  transcriptional regulator, XRE family  28.12 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3404  XRE family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  30.3 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  19.37 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  30.3 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 288 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2571  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 475 aa  43.5  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.576414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>