29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9326 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9326  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
452 aa  889    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607046  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3542  helix-turn-helix domain-containing protein  58.2 
 
 
442 aa  463  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  0.855489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  36.16 
 
 
487 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  31.81 
 
 
432 aa  140  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  30.25 
 
 
430 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3127  helix-turn-helix domain protein  32.89 
 
 
434 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.641093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2224  helix-turn-helix domain protein  35.05 
 
 
403 aa  110  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.163485  hitchhiker  0.00213028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5721  hypothetical protein  39.46 
 
 
431 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380907  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5720  hypothetical protein  26.09 
 
 
460 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  42.62 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  42.62 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  42.62 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  42.62 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  42.62 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  42.62 
 
 
404 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  40.98 
 
 
404 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  39.34 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  39.34 
 
 
403 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0172  helix-turn-helix domain-containing protein  26.86 
 
 
313 aa  50.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
422 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0397  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.09 
 
 
475 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264481  normal  0.0251152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  32.79 
 
 
423 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3185  transcriptional regulator, XRE family  34.52 
 
 
421 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  30.3 
 
 
421 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3404  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 
424 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  30.3 
 
 
421 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 
264 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 
435 aa  43.9  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>