148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0026 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 435 aa  886    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  28.76 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  28.76 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  27.11 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  26.45 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  26.81 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  26.81 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  26.81 
 
 		 403 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  26.35 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  26.71 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  25.38 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  25.38 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  25.38 
 
 		 294 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  25.38 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  25.38 
 
 		 294 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1434  helix-turn-helix domain-containing protein  25.6 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.673914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  25.38 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  25.39 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  23.9 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0510  transcriptional activator (transcriptional regulator)  23.4 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.924451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  25.2 
 
 		 285 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  23.79 
 
 		 297 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0508  transcriptional activator (transcriptional regulator)  23.4 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.66 
 
 		 636 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 292 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1433  hypothetical protein  26.88 
 
 		 421 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.38 
 
 		 1279 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  24.29 
 
 		 297 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 436 aa  53.9  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2224  helix-turn-helix domain protein  30.84 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.163485  hitchhiker  0.00213028 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  24.55 
 
 		 285 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  24.09 
 
 		 285 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  24.09 
 
 		 285 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  41.43 
 
 		 181 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 181 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 181 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  41.43 
 
 		 181 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  41.43 
 
 		 181 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  41.43 
 
 		 181 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  41.43 
 
 		 181 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  41.43 
 
 		 181 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  24.3 
 
 		 292 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 		 105 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  22.98 
 
 		 297 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1699  hypothetical protein  35.09 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000791794  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 242 aa  50.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  40 
 
 		 181 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  24.09 
 
 		 285 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 184 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  33.66 
 
 		 184 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0665  transcriptional regulator  23.49 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3325  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 132 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0668  transcriptional regulator, XRE family  21.9 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 128 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1019  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 107 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 1261 aa  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  24.91 
 
 		 301 aa  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 178 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0566  transcriptional regulator  21.93 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  36.51 
 
 		 213 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0597  transcriptional regulator  21.93 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.2 
 
 		 1154 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  42.42 
 
 		 188 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 181 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  34.48 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 175 aa  47.4  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5721  hypothetical protein  29.9 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 178 aa  47.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06770  predicted transcriptional regulator  36.25 
 
 		 106 aa  47  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  26.9 
 
 		 1288 aa  47  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 182 aa  47  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0523  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 631 aa  46.6  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0179552  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 198 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0514  helix-turn-helix domain-containing protein  34.21 
 
 		 426 aa  46.6  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  23.42 
 
 		 452 aa  46.6  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  25.12 
 
 		 421 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3149  putative transcription regulator protein  35.94 
 
 		 113 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369647 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2835  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 179 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1934  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 179 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1805  putative regulator protein  23.58 
 
 		 708 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569489 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0198  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 109 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  24.8 
 
 		 1056 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0979  GGDEF family protein  24.5 
 
 		 667 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 176 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  22.4 
 
 		 650 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0423  transcriptional regulator/TPR domain protein, putative  21.15 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 256 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 		 1054 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 179 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 174 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 179 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3225  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 93 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>