62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0335 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 301 aa  609  1e-173  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  26.84 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  28.03 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  23.15 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  22.82 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  22.82 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  22.82 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  23.67 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  27.41 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  22.82 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  24.63 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  27.1 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  27.1 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  24.92 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1356  helix-turn-helix domain-containing protein  23.33 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00217094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  37.33 
 
 		 213 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  37.33 
 
 		 285 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  37.84 
 
 		 288 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4129  transcriptional regulator, XRE family  25.63 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  37.33 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  37.33 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0423  transcriptional regulator/TPR domain protein, putative  37.5 
 
 		 427 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  32.67 
 
 		 436 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  45.9 
 
 		 421 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  45.9 
 
 		 421 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  23.74 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1212  transcriptional regulator, XRE family  25.21 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1315  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000145495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4702  transcriptional activator  33 
 
 		 419 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00084826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  23.35 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0636  transcriptional activator  31.48 
 
 		 423 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0725  transcriptional activator  33 
 
 		 419 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0512  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 419 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  24.91 
 
 		 435 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0566  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0665  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 425 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0508  transcriptional activator (transcriptional regulator)  34.44 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 422 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0654  DNA-binding protein  33 
 
 		 424 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000206988 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0597  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0510  transcriptional activator (transcriptional regulator)  34.44 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.924451  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0514  helix-turn-helix domain-containing protein  40.32 
 
 		 426 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0668  transcriptional regulator, XRE family  49.02 
 
 		 424 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  45.1 
 
 		 423 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1554  XRE family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2474  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 267 aa  46.2  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  32.43 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000308908  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1693  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0267924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  51.02 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  40.38 
 
 		 421 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2571  helix-turn-helix domain protein  41.51 
 
 		 475 aa  43.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.576414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 503 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3185  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 421 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3404  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 424 aa  42.7  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 432 aa  42.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0223131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>