65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L466_0425 on replicon NC_007103
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  100 
 
 
297 aa  596  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  88.55 
 
 
297 aa  531  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  86.53 
 
 
297 aa  518  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  78.84 
 
 
294 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  78.5 
 
 
294 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  78.84 
 
 
294 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  78.84 
 
 
294 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  77.82 
 
 
294 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  77.82 
 
 
294 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1315  transcriptional regulator, XRE family  79.66 
 
 
300 aa  437  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000145495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1212  transcriptional regulator, XRE family  82.03 
 
 
298 aa  431  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4129  transcriptional regulator, XRE family  81.54 
 
 
298 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  68.15 
 
 
292 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  68.17 
 
 
292 aa  381  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  30.69 
 
 
288 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  30.88 
 
 
285 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  28.14 
 
 
285 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  27.12 
 
 
285 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  29.18 
 
 
285 aa  99  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  29.18 
 
 
285 aa  99  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  29.18 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  26.69 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  28.47 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  28.84 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1693  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0267924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1356  helix-turn-helix domain-containing protein  24.04 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00217094  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  24.63 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  28.24 
 
 
421 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  28.24 
 
 
421 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 
422 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2859  helix-turn-helix domain-containing protein  22.64 
 
 
316 aa  53.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000554172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 
432 aa  52.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1554  XRE family transcriptional regulator  40.7 
 
 
310 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 
436 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2474  XRE family transcriptional regulator  32.65 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  22.98 
 
 
435 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  40.35 
 
 
423 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 
433 aa  49.3  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0172  helix-turn-helix domain-containing protein  32.73 
 
 
313 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  25.2 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000308908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0512  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 
419 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  35.09 
 
 
421 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  32.26 
 
 
404 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  27.27 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  26.32 
 
 
403 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  26.87 
 
 
403 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  26.87 
 
 
403 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  26.87 
 
 
403 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  26.87 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  26.87 
 
 
403 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2039  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0636  transcriptional activator  32.95 
 
 
423 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0597  transcriptional regulator  32.29 
 
 
422 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0665  transcriptional regulator  34.15 
 
 
425 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0423  transcriptional regulator/TPR domain protein, putative  39.66 
 
 
427 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0566  transcriptional regulator  32.29 
 
 
422 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
190 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0725  transcriptional activator  32.95 
 
 
419 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4702  transcriptional activator  32.95 
 
 
419 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00084826 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  25.56 
 
 
403 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0510  transcriptional activator (transcriptional regulator)  31.82 
 
 
423 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.924451  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0654  DNA-binding protein  32.95 
 
 
424 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000206988 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0508  transcriptional activator (transcriptional regulator)  31.82 
 
 
423 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2379  hypothetical protein  29.23 
 
 
156 aa  42.4  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>