88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3869 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 288 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  80.49 
 
 		 287 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  70.57 
 
 		 285 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  70.57 
 
 		 285 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  69.86 
 
 		 285 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  67.25 
 
 		 285 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  66.55 
 
 		 285 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  67.25 
 
 		 285 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  65.49 
 
 		 285 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  71.7 
 
 		 213 aa  315  6e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  30.34 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  30.69 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  31.54 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  28.67 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  28.67 
 
 		 294 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  28.67 
 
 		 294 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  28.67 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  28.32 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  28.32 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1315  transcriptional regulator, XRE family  28.81 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000145495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1212  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4129  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1693  XRE family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0267924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2859  helix-turn-helix domain-containing protein  25.44 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000554172  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  37.84 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 423 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 436 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  36 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  35.48 
 
 		 421 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  35.48 
 
 		 421 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 422 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 173 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 366 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1554  XRE family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0665  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 425 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0636  transcriptional activator  29.41 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0725  transcriptional activator  34.92 
 
 		 419 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 106 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000308908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 107 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0508  transcriptional activator (transcriptional regulator)  34.92 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0510  transcriptional activator (transcriptional regulator)  34.92 
 
 		 423 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.924451  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0654  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 424 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000206988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4702  transcriptional activator  33.33 
 
 		 419 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00084826 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 176 aa  47.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 188 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 174 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  35.62 
 
 		 421 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0566  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 422 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0597  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 422 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  36.17 
 
 		 112 aa  46.2  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  32.97 
 
 		 189 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 404 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2474  XRE family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0514  helix-turn-helix domain-containing protein  28.71 
 
 		 426 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1434  helix-turn-helix domain-containing protein  28.47 
 
 		 433 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.673914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  29.11 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 152 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 110 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 198 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  28.75 
 
 		 197 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  37.1 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  24.41 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  33.91 
 
 		 404 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0668  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 424 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 432 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0856  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.609139  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9535  hypothetical transcription regulator protein  35.21 
 
 		 88 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111117  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 161 aa  43.9  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1419  Cro/CI family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 142 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 189 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 403 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  31.34 
 
 		 403 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  31.34 
 
 		 403 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  44.23 
 
 		 403 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  31.34 
 
 		 403 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 187 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 131 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  44.23 
 
 		 403 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 178 aa  43.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 403 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 218 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 191 aa  42.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  29.11 
 
 		 190 aa  42.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 184 aa  42.4  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>