More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3280 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 452 aa  922    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3013  peptidase M48, Ste24p  41.01 
 
 		 475 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0874514  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1295  peptidase M48, Ste24p  43.27 
 
 		 453 aa  320  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.226604  normal  0.704605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2571  peptidase M48 Ste24p  40.09 
 
 		 473 aa  317  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4208  hypothetical protein  40.91 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.961779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2439  peptidase M48, Ste24p  40.47 
 
 		 475 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2861  peptidase M48, Ste24p  39.95 
 
 		 472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2723  peptidase M48 Ste24p  38.86 
 
 		 475 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.205433  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1749  peptidase M48, Ste24p  38.48 
 
 		 477 aa  300  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.165401 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2184  peptidase M48, Ste24p  38.96 
 
 		 473 aa  299  6e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1712  peptidase M48, Ste24p  38.55 
 
 		 491 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189246  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3498  peptidase M48 Ste24p  39.09 
 
 		 475 aa  278  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.814298  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3849  peptidase M48, Ste24p  42.96 
 
 		 460 aa  276  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3171  peptidase M48, Ste24p  41.75 
 
 		 467 aa  275  9e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0504963  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0230  peptidase M48, Ste24p  40.14 
 
 		 461 aa  275  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393595  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2425  peptidase M48  37.78 
 
 		 457 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1167  peptidase M48 Ste24p  36.78 
 
 		 448 aa  242  7.999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.136165  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2270  peptidase M48 Ste24p  35.2 
 
 		 471 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0910  hypothetical protein  35.24 
 
 		 471 aa  239  9e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0906  hypothetical protein  35.24 
 
 		 489 aa  239  9e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0864  peptidase M48, Ste24p  37.65 
 
 		 473 aa  224  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0891552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0652  M48 family peptidase  28.6 
 
 		 426 aa  185  2.0000000000000003e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.59081  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0661  peptidase M48, Ste24p  27.74 
 
 		 435 aa  180  4e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0347  M48 family peptidase  26.03 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  28.81 
 
 		 461 aa  146  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  30.94 
 
 		 502 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  28.34 
 
 		 470 aa  122  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  27.65 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  26.18 
 
 		 474 aa  113  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  27.19 
 
 		 472 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  29.63 
 
 		 483 aa  113  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  25.91 
 
 		 481 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  26.24 
 
 		 480 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  25.84 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  34.54 
 
 		 588 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  31.1 
 
 		 569 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  34.1 
 
 		 564 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  35.64 
 
 		 549 aa  104  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  34.54 
 
 		 588 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  34.54 
 
 		 588 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  26.79 
 
 		 477 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  33.85 
 
 		 564 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  34.02 
 
 		 589 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  25.08 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  30.71 
 
 		 567 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  31.34 
 
 		 605 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 564 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  26.28 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  33.51 
 
 		 593 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  35.23 
 
 		 521 aa  100  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  23.55 
 
 		 487 aa  99.8  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  28.01 
 
 		 561 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  33.53 
 
 		 548 aa  99.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  26.32 
 
 		 562 aa  99.4  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  33.16 
 
 		 560 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  33.16 
 
 		 572 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  24.18 
 
 		 487 aa  99  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  33.16 
 
 		 589 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  33.16 
 
 		 572 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  33.16 
 
 		 589 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  33.16 
 
 		 572 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  33.16 
 
 		 572 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  27.25 
 
 		 484 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  34.71 
 
 		 553 aa  97.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  35.63 
 
 		 541 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  27.02 
 
 		 484 aa  97.8  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  32.29 
 
 		 590 aa  97.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  26.89 
 
 		 524 aa  97.1  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  23.23 
 
 		 473 aa  96.7  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  31.34 
 
 		 573 aa  96.7  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  24.46 
 
 		 485 aa  96.3  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  31.37 
 
 		 561 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  23.82 
 
 		 490 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  32.29 
 
 		 562 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  26.54 
 
 		 553 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  26.56 
 
 		 494 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  25.27 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  25.91 
 
 		 488 aa  95.5  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  25.27 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  27.84 
 
 		 479 aa  95.5  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  31.77 
 
 		 569 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  27.84 
 
 		 469 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  25.27 
 
 		 489 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  28.23 
 
 		 481 aa  94.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  26.67 
 
 		 494 aa  94  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  32.57 
 
 		 514 aa  94.4  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  25 
 
 		 489 aa  93.2  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  24.93 
 
 		 478 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  22.68 
 
 		 487 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 521 aa  92.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 521 aa  92.8  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  24.93 
 
 		 478 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  24.92 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  24.32 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  29.01 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  24.93 
 
 		 478 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  24.92 
 
 		 487 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  24.92 
 
 		 487 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  32.37 
 
 		 554 aa  91.3  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>