More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1167 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1167  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 448 aa  882    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.136165  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0864  peptidase M48, Ste24p  51.77 
 
 		 473 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0891552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  37.32 
 
 		 452 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2425  peptidase M48  36.49 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1295  peptidase M48, Ste24p  35.18 
 
 		 453 aa  223  7e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.226604  normal  0.704605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3171  peptidase M48, Ste24p  36.3 
 
 		 467 aa  221  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0504963  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3849  peptidase M48, Ste24p  36.05 
 
 		 460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3013  peptidase M48, Ste24p  33.25 
 
 		 475 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0874514  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2571  peptidase M48 Ste24p  34.29 
 
 		 473 aa  206  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2439  peptidase M48, Ste24p  31.71 
 
 		 475 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2861  peptidase M48, Ste24p  32.94 
 
 		 472 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4208  hypothetical protein  31.62 
 
 		 465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.961779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0230  peptidase M48, Ste24p  34.58 
 
 		 461 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393595  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3498  peptidase M48 Ste24p  31.47 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.814298  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1749  peptidase M48, Ste24p  31.45 
 
 		 477 aa  195  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.165401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2723  peptidase M48 Ste24p  29.86 
 
 		 475 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.205433  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1712  peptidase M48, Ste24p  32.23 
 
 		 491 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189246  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0661  peptidase M48, Ste24p  27.05 
 
 		 435 aa  173  5.999999999999999e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2184  peptidase M48, Ste24p  31.15 
 
 		 473 aa  171  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0652  M48 family peptidase  26.25 
 
 		 426 aa  159  8e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.59081  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0347  M48 family peptidase  25.61 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0910  hypothetical protein  29.93 
 
 		 471 aa  146  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0906  hypothetical protein  29.93 
 
 		 489 aa  146  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2270  peptidase M48 Ste24p  30.56 
 
 		 471 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  31.99 
 
 		 461 aa  123  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  27.36 
 
 		 472 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  27.76 
 
 		 470 aa  106  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 483 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  23.24 
 
 		 485 aa  98.6  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  24.94 
 
 		 494 aa  96.7  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  26.21 
 
 		 488 aa  96.3  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  25.53 
 
 		 481 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  24.94 
 
 		 524 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  24.94 
 
 		 494 aa  96.3  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  24.16 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  24.16 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  24.16 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  24.16 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  26.67 
 
 		 480 aa  94.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  23.9 
 
 		 489 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  31.69 
 
 		 605 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 573 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  24.26 
 
 		 503 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  33.71 
 
 		 533 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  31.71 
 
 		 553 aa  91.7  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  26.07 
 
 		 487 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  26.07 
 
 		 487 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  26.07 
 
 		 487 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  23.24 
 
 		 494 aa  89.4  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  25.12 
 
 		 487 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  26.07 
 
 		 487 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  26.07 
 
 		 487 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  25.35 
 
 		 487 aa  87.8  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  23.12 
 
 		 489 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  22.27 
 
 		 486 aa  87.4  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  26.69 
 
 		 490 aa  87.4  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  23.5 
 
 		 489 aa  87  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  22.86 
 
 		 489 aa  87  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  30.21 
 
 		 490 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  25.48 
 
 		 487 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  25.47 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  24.48 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  25.53 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  22.6 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  23.12 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  24.02 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  24.77 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  24.43 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  24.43 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  24.43 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  24.43 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  24.43 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  24.43 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  24.43 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  24.43 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  27.02 
 
 		 486 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  24.43 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  23.61 
 
 		 484 aa  82  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  24.19 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  24.22 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  25.14 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  30.21 
 
 		 475 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  29.29 
 
 		 514 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  23.41 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  32.42 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  23.84 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  27.62 
 
 		 562 aa  78.2  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  31.66 
 
 		 521 aa  77.4  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  30.61 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  22.78 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  31.66 
 
 		 521 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  31.5 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  24.17 
 
 		 481 aa  76.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  29.1 
 
 		 567 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  28.44 
 
 		 590 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  32.32 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  31.28 
 
 		 502 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  25.91 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  26.6 
 
 		 561 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>