More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0864 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0864  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 473 aa  950    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0891552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1167  peptidase M48 Ste24p  52.25 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.136165  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  37.5 
 
 		 452 aa  240  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2425  peptidase M48  37.16 
 
 		 457 aa  239  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1295  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 453 aa  210  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.226604  normal  0.704605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4208  hypothetical protein  32.79 
 
 		 465 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.961779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1749  peptidase M48, Ste24p  32.07 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.165401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3013  peptidase M48, Ste24p  32.08 
 
 		 475 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0874514  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1712  peptidase M48, Ste24p  35.15 
 
 		 491 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2861  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2439  peptidase M48, Ste24p  31.78 
 
 		 475 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3498  peptidase M48 Ste24p  32.02 
 
 		 475 aa  195  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.814298  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2184  peptidase M48, Ste24p  30.62 
 
 		 473 aa  195  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2723  peptidase M48 Ste24p  30.89 
 
 		 475 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.205433  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3171  peptidase M48, Ste24p  34.91 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0504963  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2571  peptidase M48 Ste24p  33.03 
 
 		 473 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0661  peptidase M48, Ste24p  26.95 
 
 		 435 aa  189  5.999999999999999e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3849  peptidase M48, Ste24p  34.2 
 
 		 460 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0230  peptidase M48, Ste24p  35.29 
 
 		 461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393595  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0910  hypothetical protein  32.48 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0906  hypothetical protein  32.48 
 
 		 489 aa  178  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0652  M48 family peptidase  28.74 
 
 		 426 aa  176  9e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.59081  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0347  M48 family peptidase  25.12 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2270  peptidase M48 Ste24p  32.88 
 
 		 471 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  28.12 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  27.17 
 
 		 502 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  24.45 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  23.78 
 
 		 474 aa  98.2  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  25.13 
 
 		 489 aa  97.1  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  24.37 
 
 		 472 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  26.58 
 
 		 480 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  25.44 
 
 		 481 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  24.41 
 
 		 486 aa  91.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  24.36 
 
 		 489 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  24.36 
 
 		 489 aa  90.9  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  27.78 
 
 		 436 aa  90.1  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  35.03 
 
 		 605 aa  90.1  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  24.1 
 
 		 489 aa  90.1  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  31.78 
 
 		 553 aa  87.8  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  25.33 
 
 		 485 aa  87  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  32.26 
 
 		 561 aa  86.7  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  24.55 
 
 		 489 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  24.55 
 
 		 489 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  24.55 
 
 		 489 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  24.55 
 
 		 489 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  33.95 
 
 		 521 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  31.03 
 
 		 573 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  30.28 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  31.89 
 
 		 567 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  23.96 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  23.96 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  23.72 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  24.09 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  24.09 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  24.09 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  24.87 
 
 		 489 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  24.04 
 
 		 486 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  31.35 
 
 		 569 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  24.3 
 
 		 486 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  23.26 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  32.3 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  32.02 
 
 		 549 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  31.52 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  32.5 
 
 		 541 aa  80.1  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  32.96 
 
 		 271 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  23.27 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  22.28 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  32.56 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  29.24 
 
 		 561 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  32.92 
 
 		 554 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  29.24 
 
 		 553 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  28.5 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  27.6 
 
 		 518 aa  77.4  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  24.87 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  22.02 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  22.02 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  24.48 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  22.02 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  22.02 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  22.02 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  31.06 
 
 		 569 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  22.02 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  33.13 
 
 		 564 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  32.76 
 
 		 564 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  22.02 
 
 		 487 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  22.02 
 
 		 487 aa  76.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  31.06 
 
 		 590 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  33.73 
 
 		 593 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  22.37 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  26.44 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  31.71 
 
 		 588 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0358  peptidase M48, Ste24p  30.49 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000622653  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  22.74 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  29.01 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  29.89 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  28.44 
 
 		 564 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  30.43 
 
 		 588 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  30.43 
 
 		 588 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  22.29 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>