More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0229 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  92.41 
 
 
561 aa  1046    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
553 aa  1136    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0358  peptidase M48, Ste24p  50.31 
 
 
533 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000622653  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  32.55 
 
 
474 aa  180  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  30.25 
 
 
567 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  30.25 
 
 
569 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  27.11 
 
 
503 aa  171  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  30.75 
 
 
561 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  28.67 
 
 
478 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  28.41 
 
 
489 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  27.15 
 
 
489 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  27.9 
 
 
478 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  27.77 
 
 
478 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  27.77 
 
 
478 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  26.96 
 
 
489 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  26.77 
 
 
489 aa  160  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  29.4 
 
 
605 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  29.7 
 
 
500 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  26.96 
 
 
485 aa  158  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  39.81 
 
 
573 aa  157  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  29.84 
 
 
484 aa  156  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  27.89 
 
 
484 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  30.43 
 
 
521 aa  156  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  27.85 
 
 
562 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  28.47 
 
 
473 aa  151  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  29.97 
 
 
488 aa  150  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  27.66 
 
 
489 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  27.66 
 
 
489 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  27.66 
 
 
489 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  27.66 
 
 
489 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  26.87 
 
 
487 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  27.84 
 
 
486 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  30.48 
 
 
477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  32.39 
 
 
494 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  28.75 
 
 
486 aa  146  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  26.58 
 
 
484 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  34.81 
 
 
477 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  29.7 
 
 
477 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  36.32 
 
 
572 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  36.32 
 
 
572 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  33.59 
 
 
502 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  36.32 
 
 
572 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  36.32 
 
 
572 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  36.32 
 
 
560 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  36.32 
 
 
589 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  36.32 
 
 
589 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  28.02 
 
 
485 aa  143  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  27.74 
 
 
565 aa  143  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  28.45 
 
 
489 aa  143  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  28.92 
 
 
478 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  28.64 
 
 
478 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  26.77 
 
 
487 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  36.21 
 
 
481 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  28.12 
 
 
489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  29.94 
 
 
590 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  40.57 
 
 
564 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  40.57 
 
 
588 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  40.57 
 
 
564 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  40.57 
 
 
588 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  35.9 
 
 
589 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  26.53 
 
 
483 aa  140  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  40 
 
 
588 aa  140  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  40.57 
 
 
593 aa  140  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  27.55 
 
 
487 aa  140  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
490 aa  140  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 
564 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  27.19 
 
 
490 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  27.07 
 
 
487 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  27.07 
 
 
487 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  27.86 
 
 
524 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  27.07 
 
 
487 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  28.02 
 
 
487 aa  139  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  31.9 
 
 
475 aa  137  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  28.43 
 
 
479 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  35.66 
 
 
562 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  26.24 
 
 
484 aa  137  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  27.2 
 
 
494 aa  137  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  27.2 
 
 
494 aa  137  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  31.58 
 
 
411 aa  137  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  27.07 
 
 
487 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  27.07 
 
 
487 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  26.29 
 
 
488 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  26.53 
 
 
487 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  29.78 
 
 
480 aa  136  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  31.38 
 
 
533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  26.19 
 
 
487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  28.1 
 
 
486 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  37.57 
 
 
569 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  25.96 
 
 
487 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  25.96 
 
 
487 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  25.96 
 
 
487 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  25.96 
 
 
487 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  25.96 
 
 
487 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  25.96 
 
 
487 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  25.96 
 
 
487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  29.64 
 
 
487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  25.73 
 
 
487 aa  131  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  37.91 
 
 
514 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  28.23 
 
 
477 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.283962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>