More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1712 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1712  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 491 aa  993    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189246  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0910  hypothetical protein  56.07 
 
 		 471 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0906  hypothetical protein  54.81 
 
 		 489 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2270  peptidase M48 Ste24p  55.85 
 
 		 471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3013  peptidase M48, Ste24p  45.79 
 
 		 475 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0874514  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2723  peptidase M48 Ste24p  44.59 
 
 		 475 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.205433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4208  hypothetical protein  46.87 
 
 		 465 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.961779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2439  peptidase M48, Ste24p  44.52 
 
 		 475 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1749  peptidase M48, Ste24p  43.04 
 
 		 477 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.165401 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2184  peptidase M48, Ste24p  44.81 
 
 		 473 aa  354  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2861  peptidase M48, Ste24p  45.32 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3498  peptidase M48 Ste24p  44.5 
 
 		 475 aa  332  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.814298  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  37.87 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2571  peptidase M48 Ste24p  38.46 
 
 		 473 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2425  peptidase M48  37.39 
 
 		 457 aa  243  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1295  peptidase M48, Ste24p  34.53 
 
 		 453 aa  233  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.226604  normal  0.704605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3849  peptidase M48, Ste24p  36.12 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3171  peptidase M48, Ste24p  33.85 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0504963  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0230  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 461 aa  200  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393595  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0864  peptidase M48, Ste24p  34.79 
 
 		 473 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0891552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0347  M48 family peptidase  26.92 
 
 		 435 aa  176  8e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0661  peptidase M48, Ste24p  27.61 
 
 		 435 aa  176  9.999999999999999e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1167  peptidase M48 Ste24p  32.67 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.136165  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_002978  WD0652  M48 family peptidase  26.27 
 
 		 426 aa  161  3e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.59081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  26.64 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  25.38 
 
 		 483 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  24.87 
 
 		 484 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  24.48 
 
 		 484 aa  95.1  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  25.9 
 
 		 484 aa  94.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  25.45 
 
 		 487 aa  93.6  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  25.23 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  25.23 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  25.23 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  24.83 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  25.23 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  25.23 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  25.23 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  25.23 
 
 		 487 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  24.78 
 
 		 487 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  24.78 
 
 		 487 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  25.11 
 
 		 487 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  25.11 
 
 		 487 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  25.11 
 
 		 487 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  29.82 
 
 		 470 aa  88.6  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  24.15 
 
 		 487 aa  89  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  23.58 
 
 		 424 aa  87.4  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  27.05 
 
 		 484 aa  87  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  26.72 
 
 		 605 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  23.8 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  25.3 
 
 		 503 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  25.31 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  34.42 
 
 		 567 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  24.65 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  24.19 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  26.37 
 
 		 562 aa  82.8  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  22.14 
 
 		 474 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  28.08 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  33.95 
 
 		 569 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  26.11 
 
 		 573 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  25.44 
 
 		 474 aa  81.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  34.71 
 
 		 553 aa  80.9  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  25.94 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  32.45 
 
 		 565 aa  80.9  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  26.55 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  30.81 
 
 		 490 aa  80.5  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  23.77 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  25.23 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  26.75 
 
 		 564 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  23.53 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  22.88 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  23.46 
 
 		 524 aa  78.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  26.94 
 
 		 564 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  26.72 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  22.5 
 
 		 485 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  23.04 
 
 		 494 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  26.49 
 
 		 564 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  26.94 
 
 		 588 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  26.94 
 
 		 588 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  23.7 
 
 		 486 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  22.8 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  22.2 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  27.63 
 
 		 518 aa  74.3  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  26.49 
 
 		 561 aa  73.6  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  21.78 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  26.58 
 
 		 588 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  31.79 
 
 		 593 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  25.8 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  31.25 
 
 		 549 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  24.89 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  23.02 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 554 aa  70.9  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  24.17 
 
 		 487 aa  70.5  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  24.43 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  24.43 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  23.68 
 
 		 469 aa  70.1  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  26.83 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  24.43 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  30.06 
 
 		 589 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  30.06 
 
 		 569 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>