More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1749 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2723  peptidase M48 Ste24p  73.91 
 
 		 475 aa  676    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.205433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4208  hypothetical protein  81.44 
 
 		 465 aa  696    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.961779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1749  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 477 aa  972    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.165401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3013  peptidase M48, Ste24p  77.24 
 
 		 475 aa  692    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0874514  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2861  peptidase M48, Ste24p  76.54 
 
 		 472 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2439  peptidase M48, Ste24p  78.62 
 
 		 475 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2184  peptidase M48, Ste24p  84.5 
 
 		 473 aa  764    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3498  peptidase M48 Ste24p  55.95 
 
 		 475 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.814298  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_004310  BR0910  hypothetical protein  47.05 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0906  hypothetical protein  47.05 
 
 		 489 aa  371  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2270  peptidase M48 Ste24p  47.26 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1712  peptidase M48, Ste24p  43.04 
 
 		 491 aa  359  6e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189246  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1295  peptidase M48, Ste24p  40.65 
 
 		 453 aa  319  7e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.226604  normal  0.704605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  39.13 
 
 		 452 aa  300  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3849  peptidase M48, Ste24p  38.53 
 
 		 460 aa  263  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0230  peptidase M48, Ste24p  36.99 
 
 		 461 aa  259  7e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393595  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3171  peptidase M48, Ste24p  37.39 
 
 		 467 aa  259  9e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0504963  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2571  peptidase M48 Ste24p  35.93 
 
 		 473 aa  256  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2425  peptidase M48  33.57 
 
 		 457 aa  220  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0661  peptidase M48, Ste24p  29.26 
 
 		 435 aa  186  9e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0864  peptidase M48, Ste24p  31.8 
 
 		 473 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0891552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0347  M48 family peptidase  28.8 
 
 		 435 aa  182  8.000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1167  peptidase M48 Ste24p  30.41 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.136165  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_002978  WD0652  M48 family peptidase  24.5 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.59081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  28.2 
 
 		 461 aa  136  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  22.94 
 
 		 486 aa  96.7  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  24.11 
 
 		 488 aa  94  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  23.52 
 
 		 487 aa  91.3  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  24.69 
 
 		 485 aa  90.9  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  31.25 
 
 		 549 aa  90.1  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  27.38 
 
 		 477 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 		 514 aa  88.2  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  26.67 
 
 		 477 aa  87  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  24.22 
 
 		 424 aa  86.7  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  23.88 
 
 		 487 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  24.21 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  25.99 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  26.68 
 
 		 490 aa  84.7  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  25.85 
 
 		 589 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  24.15 
 
 		 524 aa  84  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  24.15 
 
 		 494 aa  83.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  24.15 
 
 		 494 aa  83.6  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  26.33 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  28 
 
 		 562 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  28.3 
 
 		 502 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  22.44 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  25.37 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  25.74 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  22.33 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  25 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  29.89 
 
 		 562 aa  81.3  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  25.37 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  27 
 
 		 593 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 565 aa  80.5  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  25.85 
 
 		 572 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  25.85 
 
 		 560 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  23.86 
 
 		 490 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  25.85 
 
 		 589 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  28.37 
 
 		 588 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  25.85 
 
 		 572 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  25.85 
 
 		 572 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  25.85 
 
 		 572 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  25.85 
 
 		 589 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  23.64 
 
 		 487 aa  80.1  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  26.24 
 
 		 554 aa  80.5  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  25.37 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  22.43 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  31.25 
 
 		 521 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  28.7 
 
 		 564 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  31.25 
 
 		 521 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  26.34 
 
 		 533 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  29.24 
 
 		 548 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  29.55 
 
 		 541 aa  79.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  28.37 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  28.37 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  28.3 
 
 		 564 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  28.3 
 
 		 564 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  23.33 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  23.21 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  25.45 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  26.47 
 
 		 521 aa  77.4  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  21.93 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  21.86 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  20.95 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  21.86 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  21.86 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  21.86 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  29.95 
 
 		 573 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  25.55 
 
 		 590 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  30.56 
 
 		 553 aa  76.6  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  23.12 
 
 		 473 aa  76.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  26.29 
 
 		 561 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  24.44 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  26.26 
 
 		 605 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  22.19 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  29.27 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  28.76 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  22.91 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  28.48 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>