More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4208 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1749  peptidase M48, Ste24p  78.24 
 
 		 477 aa  689    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.165401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3013  peptidase M48, Ste24p  79.68 
 
 		 475 aa  704    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0874514  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2861  peptidase M48, Ste24p  77.59 
 
 		 472 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2439  peptidase M48, Ste24p  81.67 
 
 		 475 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2184  peptidase M48, Ste24p  79.52 
 
 		 473 aa  683    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2723  peptidase M48 Ste24p  76.2 
 
 		 475 aa  688    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.205433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4208  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  935    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.961779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3498  peptidase M48 Ste24p  57.94 
 
 		 475 aa  481  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.814298  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1712  peptidase M48, Ste24p  46.07 
 
 		 491 aa  364  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189246  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0906  hypothetical protein  47.43 
 
 		 489 aa  361  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0910  hypothetical protein  47.43 
 
 		 471 aa  361  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2270  peptidase M48 Ste24p  45.53 
 
 		 471 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1295  peptidase M48, Ste24p  41.05 
 
 		 453 aa  315  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.226604  normal  0.704605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  41.63 
 
 		 452 aa  302  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2571  peptidase M48 Ste24p  36.14 
 
 		 473 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3849  peptidase M48, Ste24p  38.66 
 
 		 460 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0230  peptidase M48, Ste24p  37.47 
 
 		 461 aa  265  8.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393595  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3171  peptidase M48, Ste24p  38.21 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0504963  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2425  peptidase M48  34.07 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0864  peptidase M48, Ste24p  31.12 
 
 		 473 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0891552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1167  peptidase M48 Ste24p  31.89 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.136165  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0661  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0347  M48 family peptidase  27.93 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0652  M48 family peptidase  26.35 
 
 		 426 aa  167  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.59081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  28.89 
 
 		 461 aa  138  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  27.38 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  24.69 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  31.46 
 
 		 502 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  26.01 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  25.65 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  23.91 
 
 		 485 aa  98.2  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  25.24 
 
 		 487 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  24.56 
 
 		 486 aa  96.7  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  25.44 
 
 		 486 aa  95.5  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  24.6 
 
 		 518 aa  95.1  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  25.57 
 
 		 487 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  25.38 
 
 		 489 aa  94  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  26.99 
 
 		 481 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  27.41 
 
 		 477 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  25.47 
 
 		 487 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  25.32 
 
 		 494 aa  92.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  27.62 
 
 		 477 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  25.32 
 
 		 524 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  25.32 
 
 		 494 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  24.01 
 
 		 489 aa  91.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  24.79 
 
 		 487 aa  90.9  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  25.75 
 
 		 424 aa  90.5  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  24.75 
 
 		 473 aa  90.1  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  23.2 
 
 		 489 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  32 
 
 		 561 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  23.2 
 
 		 489 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  23.2 
 
 		 489 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  23.2 
 
 		 489 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  23.75 
 
 		 484 aa  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  24.67 
 
 		 503 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  24.64 
 
 		 481 aa  88.2  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  23.48 
 
 		 489 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  24.64 
 
 		 490 aa  87.8  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  31.87 
 
 		 562 aa  87.4  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  23.22 
 
 		 489 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  26.98 
 
 		 500 aa  87  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  23.22 
 
 		 489 aa  87  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  32.97 
 
 		 567 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  30.17 
 
 		 565 aa  86.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  25.97 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  24.81 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  32.8 
 
 		 569 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  26.68 
 
 		 564 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  25.97 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  31.03 
 
 		 549 aa  84.3  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  26.68 
 
 		 564 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  24.75 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  27.78 
 
 		 477 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  25.97 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  27.44 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  30.29 
 
 		 548 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  31.03 
 
 		 514 aa  83.2  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  27.78 
 
 		 477 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  24.37 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  26.33 
 
 		 474 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  23.82 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  25.99 
 
 		 484 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  28.49 
 
 		 521 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  27.66 
 
 		 588 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  25.84 
 
 		 488 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  32.24 
 
 		 573 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  27.4 
 
 		 593 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  24.09 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  24.09 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  24.09 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  24.09 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  25.88 
 
 		 564 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  24.09 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  24.09 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  29.19 
 
 		 605 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  24.09 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  26.15 
 
 		 588 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  24.09 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  26.15 
 
 		 588 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>