291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3498 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3498  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
475 aa  959    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.814298  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3013  peptidase M48, Ste24p  60.42 
 
 
475 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0874514  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2723  peptidase M48 Ste24p  59.07 
 
 
475 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.205433  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2439  peptidase M48, Ste24p  60.92 
 
 
475 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2861  peptidase M48, Ste24p  61.01 
 
 
472 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4208  hypothetical protein  57.99 
 
 
465 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.961779  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1749  peptidase M48, Ste24p  55.95 
 
 
477 aa  489  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.165401 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2184  peptidase M48, Ste24p  56.25 
 
 
473 aa  485  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0906  hypothetical protein  45.01 
 
 
489 aa  359  7e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0910  hypothetical protein  45.01 
 
 
471 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1712  peptidase M48, Ste24p  44.5 
 
 
491 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189246  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2270  peptidase M48 Ste24p  43.74 
 
 
471 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1295  peptidase M48, Ste24p  39.49 
 
 
453 aa  314  2.9999999999999996e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.226604  normal  0.704605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  38.61 
 
 
452 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2571  peptidase M48 Ste24p  36.38 
 
 
473 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3849  peptidase M48, Ste24p  38.95 
 
 
460 aa  257  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123819  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0230  peptidase M48, Ste24p  34.52 
 
 
461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393595  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3171  peptidase M48, Ste24p  35.65 
 
 
467 aa  243  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0504963  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2425  peptidase M48  36.1 
 
 
457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0652  M48 family peptidase  28.41 
 
 
426 aa  196  7e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.59081  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1167  peptidase M48 Ste24p  31.74 
 
 
448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.136165  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0661  peptidase M48, Ste24p  26.83 
 
 
435 aa  188  2e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0347  M48 family peptidase  26.97 
 
 
435 aa  187  4e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0864  peptidase M48, Ste24p  30.61 
 
 
473 aa  180  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0891552  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  28.3 
 
 
461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  26.1 
 
 
481 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  25.37 
 
 
502 aa  93.6  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  25.06 
 
 
490 aa  92.8  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  25.13 
 
 
473 aa  90.5  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  29.96 
 
 
562 aa  89  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  25.65 
 
 
518 aa  87.8  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  24.94 
 
 
478 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  24.68 
 
 
478 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  24.68 
 
 
478 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  23.46 
 
 
483 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  25.79 
 
 
503 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  24.77 
 
 
565 aa  84.7  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  31.79 
 
 
605 aa  85.1  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  25.75 
 
 
470 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  24.16 
 
 
478 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  24.23 
 
 
524 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  23.96 
 
 
494 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  32.98 
 
 
573 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  24.51 
 
 
485 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  25.2 
 
 
477 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  24.69 
 
 
487 aa  81.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  25.13 
 
 
477 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  26.62 
 
 
500 aa  81.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  22.73 
 
 
484 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  24.79 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  24.79 
 
 
486 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  23.58 
 
 
484 aa  80.1  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  28.09 
 
 
561 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  23.86 
 
 
474 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  23.68 
 
 
494 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  25.81 
 
 
490 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  29.2 
 
 
567 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  23.75 
 
 
488 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  29.2 
 
 
569 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  24.3 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  22.91 
 
 
487 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  23.71 
 
 
424 aa  77  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  22.77 
 
 
484 aa  76.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  27.76 
 
 
427 aa  76.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  30.05 
 
 
549 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  23.4 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  23.66 
 
 
489 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  23.92 
 
 
477 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  28.43 
 
 
564 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  28.43 
 
 
564 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  24.04 
 
 
477 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  22.34 
 
 
487 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  23.66 
 
 
489 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  29.44 
 
 
562 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  27.7 
 
 
564 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  22.13 
 
 
480 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  25.94 
 
 
479 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  24.52 
 
 
553 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  27.7 
 
 
588 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  27.7 
 
 
588 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  23.39 
 
 
489 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  25.49 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  26.37 
 
 
588 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  26.85 
 
 
593 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  23.39 
 
 
489 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  24.72 
 
 
487 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  26.29 
 
 
589 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  26.21 
 
 
514 aa  71.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  23.74 
 
 
486 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  27.45 
 
 
572 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  24.72 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  24.72 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  24.72 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  24.72 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  24.72 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  24.72 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  27.45 
 
 
572 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  27.45 
 
 
572 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  27.45 
 
 
572 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  24.72 
 
 
487 aa  70.5  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>