More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3849 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3849  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 460 aa  923    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3171  peptidase M48, Ste24p  59.11 
 
 		 467 aa  478  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0504963  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0230  peptidase M48, Ste24p  58.31 
 
 		 461 aa  470  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393595  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1295  peptidase M48, Ste24p  40.48 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.226604  normal  0.704605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  42.53 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4208  hypothetical protein  38.79 
 
 		 465 aa  292  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.961779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1749  peptidase M48, Ste24p  38.34 
 
 		 477 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.165401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3013  peptidase M48, Ste24p  38.28 
 
 		 475 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0874514  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2439  peptidase M48, Ste24p  37.86 
 
 		 475 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2723  peptidase M48 Ste24p  37.42 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.205433  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2184  peptidase M48, Ste24p  37.72 
 
 		 473 aa  276  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3498  peptidase M48 Ste24p  37.97 
 
 		 475 aa  270  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.814298  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2861  peptidase M48, Ste24p  36.57 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2571  peptidase M48 Ste24p  37.22 
 
 		 473 aa  259  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1167  peptidase M48 Ste24p  36.26 
 
 		 448 aa  237  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.136165  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1712  peptidase M48, Ste24p  35.73 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189246  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2425  peptidase M48  36.5 
 
 		 457 aa  229  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0906  hypothetical protein  34.27 
 
 		 489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0910  hypothetical protein  34.27 
 
 		 471 aa  190  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2270  peptidase M48 Ste24p  34.52 
 
 		 471 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0864  peptidase M48, Ste24p  33.64 
 
 		 473 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0891552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0347  M48 family peptidase  26.24 
 
 		 435 aa  180  5.999999999999999e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0661  peptidase M48, Ste24p  26.02 
 
 		 435 aa  173  5.999999999999999e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0652  M48 family peptidase  25.12 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.59081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  29.78 
 
 		 461 aa  140  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  28.16 
 
 		 484 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  26.68 
 
 		 487 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  26.85 
 
 		 485 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  26.34 
 
 		 487 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  26.34 
 
 		 487 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  26.28 
 
 		 487 aa  119  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  26.34 
 
 		 487 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  26.34 
 
 		 487 aa  119  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  26.34 
 
 		 487 aa  119  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  26.34 
 
 		 487 aa  119  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  26.34 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  26.34 
 
 		 487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  26.61 
 
 		 489 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  26.23 
 
 		 489 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  26.53 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  26.53 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  26.53 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  26.53 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  26.04 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  25.48 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  26.67 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  25.74 
 
 		 489 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  29.86 
 
 		 424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  25.51 
 
 		 486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  26.53 
 
 		 487 aa  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  27.05 
 
 		 488 aa  113  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  25.83 
 
 		 487 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  25.83 
 
 		 487 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  25.83 
 
 		 487 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  25.83 
 
 		 487 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  25.83 
 
 		 487 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  27.01 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  25.32 
 
 		 486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  27.27 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  28.62 
 
 		 481 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  27.97 
 
 		 490 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  26.71 
 
 		 487 aa  110  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  26.86 
 
 		 472 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  27.92 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  26.39 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  26.61 
 
 		 489 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  30.74 
 
 		 502 aa  106  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  28.24 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  27.04 
 
 		 490 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  29.67 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  32.47 
 
 		 264 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  26.38 
 
 		 479 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  26.18 
 
 		 503 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  26.7 
 
 		 484 aa  103  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  27.81 
 
 		 605 aa  103  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  25.71 
 
 		 487 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  25.06 
 
 		 483 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  26.76 
 
 		 573 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  25.51 
 
 		 489 aa  100  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  27.51 
 
 		 481 aa  99.8  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  25.18 
 
 		 494 aa  99.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  27.03 
 
 		 478 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  25.42 
 
 		 524 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  25.18 
 
 		 494 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  28.08 
 
 		 562 aa  98.2  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  27.16 
 
 		 478 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  27.48 
 
 		 478 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  27.41 
 
 		 478 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  26.55 
 
 		 488 aa  97.1  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  29.86 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  28.31 
 
 		 593 aa  96.3  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  28.85 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  29.12 
 
 		 478 aa  95.9  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  27.47 
 
 		 565 aa  95.5  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  32.98 
 
 		 494 aa  95.5  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  29.31 
 
 		 521 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  29.84 
 
 		 561 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  27.54 
 
 		 518 aa  94.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  27.7 
 
 		 484 aa  94.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>