More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2731 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  92.4 
 
 
487 aa  908    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  92.4 
 
 
487 aa  908    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  71.81 
 
 
487 aa  696    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  92.2 
 
 
487 aa  906    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  92.2 
 
 
487 aa  907    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  92.4 
 
 
487 aa  908    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  99.79 
 
 
487 aa  988    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  92.4 
 
 
487 aa  908    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  72.27 
 
 
524 aa  675    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  67.9 
 
 
487 aa  671    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  100 
 
 
487 aa  989    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  92.4 
 
 
487 aa  908    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  100 
 
 
487 aa  989    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  99.79 
 
 
487 aa  988    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  99.79 
 
 
487 aa  988    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  72.27 
 
 
494 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  72.22 
 
 
487 aa  701    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  92.4 
 
 
487 aa  908    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  88.3 
 
 
487 aa  873    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  71.6 
 
 
487 aa  694    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  72.05 
 
 
494 aa  669    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  92.2 
 
 
487 aa  906    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  69.61 
 
 
488 aa  694    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  50.31 
 
 
484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  47.42 
 
 
483 aa  418  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  47.55 
 
 
484 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  47.41 
 
 
484 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  45.93 
 
 
485 aa  388  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  44.77 
 
 
485 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  45.13 
 
 
489 aa  382  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  44.7 
 
 
489 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  44.7 
 
 
489 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  44.7 
 
 
489 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  43.86 
 
 
486 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  44.16 
 
 
489 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  44.16 
 
 
489 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  44.16 
 
 
489 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  44.16 
 
 
489 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  44.58 
 
 
488 aa  364  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  44.94 
 
 
489 aa  363  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  46.49 
 
 
490 aa  362  6e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  43.46 
 
 
489 aa  362  8e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  46.19 
 
 
486 aa  361  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  43.79 
 
 
486 aa  360  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  41.43 
 
 
487 aa  339  7e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  43.52 
 
 
481 aa  329  7e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  41.5 
 
 
483 aa  323  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  36.76 
 
 
484 aa  276  6e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.99 
 
 
503 aa  259  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  36.07 
 
 
478 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  36.07 
 
 
478 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  36.07 
 
 
478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  35.86 
 
 
478 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  37.89 
 
 
500 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  35.15 
 
 
477 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  34.19 
 
 
477 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  34.19 
 
 
473 aa  225  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  35.27 
 
 
479 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  35.55 
 
 
477 aa  216  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  39.18 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  35.11 
 
 
477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  34.17 
 
 
477 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  34.04 
 
 
477 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  37.08 
 
 
475 aa  199  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  34.11 
 
 
490 aa  196  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  31.77 
 
 
478 aa  196  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  42.15 
 
 
480 aa  196  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  31.54 
 
 
478 aa  196  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  32.14 
 
 
474 aa  195  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  30.9 
 
 
605 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  31.54 
 
 
562 aa  182  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  31.16 
 
 
573 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  31.5 
 
 
565 aa  179  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  28.98 
 
 
566 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  32.83 
 
 
481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  32.35 
 
 
486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  29.98 
 
 
483 aa  171  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  30.08 
 
 
502 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  29.9 
 
 
567 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  29.9 
 
 
569 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02491  protease  35.37 
 
 
533 aa  163  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  37.76 
 
 
494 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  34.58 
 
 
554 aa  158  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  32.38 
 
 
561 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  28.57 
 
 
568 aa  155  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  29.91 
 
 
533 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0358  peptidase M48, Ste24p  33.21 
 
 
533 aa  148  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000622653  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  29.51 
 
 
518 aa  143  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  35.56 
 
 
553 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  28.09 
 
 
590 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  28.48 
 
 
562 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  26.95 
 
 
561 aa  139  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  27.07 
 
 
553 aa  136  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  28.88 
 
 
521 aa  136  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  33.08 
 
 
392 aa  136  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  28.03 
 
 
569 aa  134  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  31.23 
 
 
564 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  31.23 
 
 
564 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 
554 aa  130  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  30.11 
 
 
548 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>