More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0230 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0230  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 461 aa  931    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393595  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3171  peptidase M48, Ste24p  62.5 
 
 		 467 aa  510  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0504963  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3849  peptidase M48, Ste24p  58.94 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1295  peptidase M48, Ste24p  42 
 
 		 453 aa  317  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.226604  normal  0.704605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  40.14 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4208  hypothetical protein  36.55 
 
 		 465 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.961779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1749  peptidase M48, Ste24p  37.33 
 
 		 477 aa  267  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.165401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3013  peptidase M48, Ste24p  35.93 
 
 		 475 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0874514  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2439  peptidase M48, Ste24p  35.93 
 
 		 475 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2861  peptidase M48, Ste24p  36.17 
 
 		 472 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2723  peptidase M48 Ste24p  35.1 
 
 		 475 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.205433  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2571  peptidase M48 Ste24p  38.03 
 
 		 473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2184  peptidase M48, Ste24p  36.48 
 
 		 473 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3498  peptidase M48 Ste24p  33.91 
 
 		 475 aa  239  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.814298  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2425  peptidase M48  37.41 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1712  peptidase M48, Ste24p  33.48 
 
 		 491 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189246  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1167  peptidase M48 Ste24p  35.07 
 
 		 448 aa  210  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.136165  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0906  hypothetical protein  33.11 
 
 		 489 aa  200  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0910  hypothetical protein  33.11 
 
 		 471 aa  199  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2270  peptidase M48 Ste24p  33.11 
 
 		 471 aa  196  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0864  peptidase M48, Ste24p  34.68 
 
 		 473 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0891552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0347  M48 family peptidase  27.38 
 
 		 435 aa  179  5.999999999999999e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0652  M48 family peptidase  26.71 
 
 		 426 aa  179  8e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.59081  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0661  peptidase M48, Ste24p  26.47 
 
 		 435 aa  177  4e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  30.02 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  26.76 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  29.84 
 
 		 573 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  27.7 
 
 		 487 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  26.91 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  28 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  26.22 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  28.88 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  27.75 
 
 		 541 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  25.27 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  27.9 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  35.35 
 
 		 605 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  26.87 
 
 		 488 aa  108  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  27.9 
 
 		 494 aa  108  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  25.65 
 
 		 485 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  27.9 
 
 		 494 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  25.93 
 
 		 487 aa  107  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  25.35 
 
 		 486 aa  107  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  26.26 
 
 		 485 aa  106  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  29.19 
 
 		 562 aa  106  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  25.14 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  25.14 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  25.14 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  25.14 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  25.66 
 
 		 484 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  25.39 
 
 		 489 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  28.03 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  29.58 
 
 		 478 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  26.57 
 
 		 487 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  31.34 
 
 		 500 aa  100  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  23.81 
 
 		 483 aa  100  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  25.78 
 
 		 481 aa  99.8  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 593 aa  99.8  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  27.03 
 
 		 490 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  26.05 
 
 		 487 aa  99.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  27.76 
 
 		 478 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  28.12 
 
 		 424 aa  99.8  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  27 
 
 		 569 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  28.86 
 
 		 564 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  30.15 
 
 		 502 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  27 
 
 		 567 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  26.89 
 
 		 487 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  26.89 
 
 		 487 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  25.35 
 
 		 489 aa  98.2  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  28.86 
 
 		 564 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  29.3 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  26.89 
 
 		 487 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  26.89 
 
 		 487 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  26.89 
 
 		 487 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  29.38 
 
 		 478 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  33.03 
 
 		 521 aa  97.1  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  28.25 
 
 		 484 aa  97.1  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  33.03 
 
 		 521 aa  97.1  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  29.43 
 
 		 564 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  24.44 
 
 		 489 aa  97.1  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  26.73 
 
 		 487 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  26.73 
 
 		 487 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  26.73 
 
 		 487 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  26.73 
 
 		 487 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  26.73 
 
 		 487 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  26.73 
 
 		 487 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 		 565 aa  95.9  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  26.73 
 
 		 487 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  24.36 
 
 		 489 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  26.43 
 
 		 487 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  33.69 
 
 		 514 aa  95.9  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  29.18 
 
 		 588 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  26.73 
 
 		 487 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  24.17 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  29.18 
 
 		 588 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  25.14 
 
 		 484 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  25.44 
 
 		 480 aa  94.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  27.59 
 
 		 518 aa  94  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  33.92 
 
 		 561 aa  93.6  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  34.76 
 
 		 589 aa  93.6  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  32.16 
 
 		 562 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>