More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2861 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1749  peptidase M48, Ste24p  74.62 
 
 		 477 aa  674    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.165401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3013  peptidase M48, Ste24p  83.79 
 
 		 475 aa  745    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0874514  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2861  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 472 aa  954    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2439  peptidase M48, Ste24p  84.55 
 
 		 475 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2723  peptidase M48 Ste24p  81.16 
 
 		 475 aa  737    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.205433  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2184  peptidase M48, Ste24p  73.84 
 
 		 473 aa  661    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4208  hypothetical protein  80.18 
 
 		 465 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.961779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3498  peptidase M48 Ste24p  60.54 
 
 		 475 aa  495  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.814298  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_004310  BR0910  hypothetical protein  45.5 
 
 		 471 aa  355  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0906  hypothetical protein  45.5 
 
 		 489 aa  355  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2270  peptidase M48 Ste24p  45.24 
 
 		 471 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1712  peptidase M48, Ste24p  44.14 
 
 		 491 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189246  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1295  peptidase M48, Ste24p  41.05 
 
 		 453 aa  319  6e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.226604  normal  0.704605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  38.39 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2571  peptidase M48 Ste24p  37.64 
 
 		 473 aa  272  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0230  peptidase M48, Ste24p  36.17 
 
 		 461 aa  252  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393595  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3171  peptidase M48, Ste24p  34.99 
 
 		 467 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0504963  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3849  peptidase M48, Ste24p  35.88 
 
 		 460 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2425  peptidase M48  35.04 
 
 		 457 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0864  peptidase M48, Ste24p  30.61 
 
 		 473 aa  189  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0891552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1167  peptidase M48 Ste24p  32.46 
 
 		 448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.136165  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0347  M48 family peptidase  27.08 
 
 		 435 aa  169  7e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0661  peptidase M48, Ste24p  27.27 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0652  M48 family peptidase  24.11 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.59081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  28.33 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  26.6 
 
 		 518 aa  99  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  33.88 
 
 		 564 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  30.2 
 
 		 502 aa  98.2  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  28.76 
 
 		 561 aa  97.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 		 562 aa  97.1  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  24.47 
 
 		 488 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  34.46 
 
 		 588 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  31.14 
 
 		 590 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 564 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  23.06 
 
 		 486 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  34.46 
 
 		 564 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  34.46 
 
 		 588 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  30.7 
 
 		 593 aa  95.9  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  34.46 
 
 		 588 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  30.7 
 
 		 569 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  31.52 
 
 		 567 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  29.44 
 
 		 572 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  28.72 
 
 		 477 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  29.44 
 
 		 560 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  27.7 
 
 		 477 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  29.44 
 
 		 589 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  29.44 
 
 		 572 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  29.44 
 
 		 589 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  26.29 
 
 		 490 aa  92.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  29.44 
 
 		 572 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  29.44 
 
 		 572 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  31.52 
 
 		 569 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  27.51 
 
 		 605 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  22.89 
 
 		 494 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  22.89 
 
 		 494 aa  87.8  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  22.89 
 
 		 524 aa  87.8  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  23.36 
 
 		 483 aa  87.4  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  30.6 
 
 		 589 aa  87.4  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  29.09 
 
 		 554 aa  87.4  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  23.54 
 
 		 487 aa  87  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  24.17 
 
 		 473 aa  86.7  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  24.08 
 
 		 484 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  22.98 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  26.25 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  32.61 
 
 		 573 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  32.21 
 
 		 548 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  24.19 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  25.07 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  30.46 
 
 		 549 aa  85.1  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  30.67 
 
 		 521 aa  84.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  23.75 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  26.35 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  24.71 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  29.89 
 
 		 514 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  24.23 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  30.2 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  27.78 
 
 		 565 aa  81.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  24.13 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  26.23 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  25.83 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  23.08 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  24 
 
 		 566 aa  81.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  28.57 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  29.12 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  23.1 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  28.57 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  25 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  25.85 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  26.22 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  22.95 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  25.85 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  25.85 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  23.1 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  22.95 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  23.47 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  29.02 
 
 		 533 aa  77.4  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  26.55 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  22.55 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  28.07 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  26.55 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>