More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0358 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0358  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
533 aa  1097    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000622653  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  48.27 
 
 
553 aa  484  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  48.47 
 
 
561 aa  478  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.57 
 
 
503 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  32.48 
 
 
569 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  31.03 
 
 
474 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  27.58 
 
 
487 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  31.68 
 
 
478 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  28.48 
 
 
562 aa  169  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  32.01 
 
 
478 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  31.03 
 
 
488 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  32.01 
 
 
478 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  27.46 
 
 
565 aa  168  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  27.32 
 
 
480 aa  167  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  32.05 
 
 
561 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  30.71 
 
 
567 aa  166  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  30.94 
 
 
478 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  28.51 
 
 
489 aa  163  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  29.18 
 
 
485 aa  163  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
489 aa  163  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
489 aa  163  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
489 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  34.87 
 
 
489 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  34.87 
 
 
489 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  34.87 
 
 
489 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  34.87 
 
 
489 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  33.91 
 
 
489 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  34.46 
 
 
484 aa  161  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  34.81 
 
 
490 aa  161  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  26.96 
 
 
605 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  35.66 
 
 
484 aa  160  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  34.1 
 
 
485 aa  160  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 
487 aa  160  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  32.07 
 
 
477 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  28.82 
 
 
573 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  35.16 
 
 
486 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  33.65 
 
 
489 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  31.33 
 
 
477 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
486 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  34.1 
 
 
487 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  29.48 
 
 
500 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  30.21 
 
 
487 aa  156  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  35.2 
 
 
560 aa  156  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  35.2 
 
 
572 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  35.2 
 
 
572 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  35.2 
 
 
589 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  35.2 
 
 
572 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  35.2 
 
 
572 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  35.2 
 
 
589 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  32.94 
 
 
487 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  32.94 
 
 
487 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  33.21 
 
 
487 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  34.62 
 
 
481 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  32.94 
 
 
487 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  33.21 
 
 
487 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  36.5 
 
 
589 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  26.11 
 
 
484 aa  153  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  35.79 
 
 
593 aa  153  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  34.21 
 
 
588 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  34.21 
 
 
588 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  33.88 
 
 
488 aa  153  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  32.85 
 
 
483 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  30.65 
 
 
477 aa  152  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  35.16 
 
 
564 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  31.37 
 
 
487 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  34.04 
 
 
564 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  32.2 
 
 
473 aa  151  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  32.93 
 
 
487 aa  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  33.77 
 
 
588 aa  151  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
486 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  31.06 
 
 
487 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  31.06 
 
 
487 aa  150  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  31.06 
 
 
487 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  31.06 
 
 
487 aa  150  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  31.06 
 
 
487 aa  150  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  31.06 
 
 
487 aa  150  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  31.06 
 
 
487 aa  150  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  33.68 
 
 
564 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  31.05 
 
 
483 aa  150  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  31.06 
 
 
487 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  27.4 
 
 
479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  33.21 
 
 
494 aa  147  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  33.47 
 
 
524 aa  147  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  33.48 
 
 
487 aa  147  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  33.47 
 
 
494 aa  147  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  33.47 
 
 
494 aa  147  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  29.91 
 
 
590 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  31.73 
 
 
533 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  31.05 
 
 
484 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  30.5 
 
 
502 aa  144  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  30.43 
 
 
569 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  34.93 
 
 
481 aa  143  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  30.64 
 
 
477 aa  143  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  32.22 
 
 
562 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  30.04 
 
 
475 aa  141  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  29.93 
 
 
477 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  35.54 
 
 
553 aa  140  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  31.83 
 
 
490 aa  140  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  31.83 
 
 
518 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
483 aa  139  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>