287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_B0295 on replicon NC_011777
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  100 
 
 
421 aa  859    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  100 
 
 
421 aa  859    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  28.76 
 
 
435 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 
436 aa  87.4  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0566  transcriptional regulator  23.02 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0597  transcriptional regulator  23.02 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.99 
 
 
2145 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 
297 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.28 
 
 
957 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0423  transcriptional regulator/TPR domain protein, putative  22.89 
 
 
427 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 
1298 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0668  transcriptional regulator, XRE family  22.8 
 
 
424 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  43.37 
 
 
404 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1315  transcriptional regulator, XRE family  25.52 
 
 
300 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000145495  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  20.63 
 
 
782 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.82 
 
 
1279 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  27.05 
 
 
294 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  26.95 
 
 
294 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  27.05 
 
 
294 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  27.05 
 
 
294 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  26.95 
 
 
294 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0654  DNA-binding protein  25.06 
 
 
424 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000206988 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0636  transcriptional activator  23.46 
 
 
423 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  23.89 
 
 
493 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
71 aa  57.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  47.06 
 
 
403 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  35.46 
 
 
403 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  45.9 
 
 
180 aa  57.4  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  47.06 
 
 
403 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  47.06 
 
 
403 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  45.07 
 
 
403 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  47.06 
 
 
403 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  48.53 
 
 
403 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  26.69 
 
 
294 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  47.06 
 
 
404 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  43.21 
 
 
106 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 
178 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0725  transcriptional activator  28.18 
 
 
419 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  27.97 
 
 
285 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  27.97 
 
 
285 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0508  transcriptional activator (transcriptional regulator)  33.66 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  27.97 
 
 
285 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0510  transcriptional activator (transcriptional regulator)  33.66 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.924451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  27.97 
 
 
285 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  36.26 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  28.24 
 
 
297 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  25.52 
 
 
292 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 
180 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 
180 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 
180 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 
180 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 
180 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  25.52 
 
 
292 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0512  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0514  helix-turn-helix domain-containing protein  22.04 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.87 
 
 
636 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 
180 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  28.07 
 
 
287 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  39.71 
 
 
430 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  27.97 
 
 
213 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  25.22 
 
 
436 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3308  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 
718 aa  54.3  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128236  hitchhiker  0.000709516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1212  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 
298 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 
297 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  27.97 
 
 
285 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
432 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
945 aa  53.5  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  27.12 
 
 
285 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4129  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 
298 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
209 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  27.97 
 
 
285 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0665  transcriptional regulator  22.07 
 
 
425 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
70 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  23.73 
 
 
825 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  22.27 
 
 
872 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  20.95 
 
 
1060 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  21.91 
 
 
1550 aa  51.6  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1693  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
289 aa  51.2  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0267924  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  32.18 
 
 
208 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
72 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
77 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 
180 aa  51.2  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 
288 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  45.28 
 
 
423 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  45 
 
 
184 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  26.95 
 
 
404 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 
1195 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
93 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  27.16 
 
 
224 aa  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  45.9 
 
 
301 aa  50.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.99 
 
 
1360 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  44.62 
 
 
187 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  44.62 
 
 
187 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  44.62 
 
 
187 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  44.62 
 
 
187 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 
175 aa  50.1  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
208 aa  49.7  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  44.83 
 
 
144 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  44.62 
 
 
187 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3508  TPR repeat-containing protein  21.97 
 
 
426 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>