58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1693 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1693  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 289 aa  579  1e-164  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0267924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  28.52 
 
 		 292 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  28.16 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  27.8 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  27.8 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  27.8 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  27.8 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  27.8 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1315  transcriptional regulator, XRE family  29.05 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000145495  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  27.87 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  27.46 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  26.74 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  26.74 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  29.37 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  26.16 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  26.97 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  26.97 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  26.72 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1212  transcriptional regulator, XRE family  27.75 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4129  transcriptional regulator, XRE family  27.63 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  26.72 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  26.7 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2474  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 267 aa  52.8  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  42.62 
 
 		 421 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  24.41 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000308908  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  42.62 
 
 		 421 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 423 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  27.43 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1434  helix-turn-helix domain-containing protein  41.94 
 
 		 433 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.673914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 92 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0856  XRE family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 275 aa  45.8  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.609139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 422 aa  45.8  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  27.87 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1401  transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 		 108 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 77 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1061  XRE family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 155 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.161431  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1554  XRE family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0443  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 140 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000554716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  25.57 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  44.26 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4546  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 140 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000650042  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  23.33 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0793  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  35.9 
 
 		 144 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0172  helix-turn-helix domain-containing protein  26.32 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  39.68 
 
 		 347 aa  42.7  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 66 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0016  transcriptional regulator, XRE family  34.52 
 
 		 138 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000711578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3208  transcriptional regulator, XRE family  35.05 
 
 		 141 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 		 436 aa  42.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 66 aa  42.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  35 
 
 		 67 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  35 
 
 		 67 aa  42  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  35 
 
 		 67 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>