68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B4129 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B4129  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
298 aa  597  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1212  transcriptional regulator, XRE family  98.32 
 
 
298 aa  585  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  80.34 
 
 
294 aa  474  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  81.21 
 
 
297 aa  477  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  80.69 
 
 
294 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  80.34 
 
 
294 aa  474  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  81.54 
 
 
297 aa  475  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  80 
 
 
294 aa  471  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  80 
 
 
294 aa  471  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  81.54 
 
 
297 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  80 
 
 
294 aa  473  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1315  transcriptional regulator, XRE family  82.37 
 
 
300 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000145495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  68.49 
 
 
292 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  67.81 
 
 
292 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  30.67 
 
 
288 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  30.38 
 
 
285 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  29.86 
 
 
285 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  28.72 
 
 
287 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  31 
 
 
285 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  30.1 
 
 
285 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  30.1 
 
 
285 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  30.1 
 
 
285 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  29.76 
 
 
285 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1356  helix-turn-helix domain-containing protein  27.96 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00217094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  29.03 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1693  XRE family transcriptional regulator  28.07 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0267924  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  25.41 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  25.18 
 
 
421 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  25.18 
 
 
421 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2859  helix-turn-helix domain-containing protein  22.44 
 
 
316 aa  56.6  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000554172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 
432 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 
422 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  24.08 
 
 
435 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2474  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 
433 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 
436 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  38.6 
 
 
421 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1554  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 
310 aa  49.3  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  38.89 
 
 
423 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  24.39 
 
 
281 aa  48.9  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000308908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0423  transcriptional regulator/TPR domain protein, putative  44.83 
 
 
427 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0512  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 
419 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2379  hypothetical protein  27.48 
 
 
156 aa  45.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  26.87 
 
 
403 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0566  transcriptional regulator  34.09 
 
 
422 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  26.87 
 
 
403 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  26.87 
 
 
403 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0597  transcriptional regulator  34.09 
 
 
422 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  26.87 
 
 
403 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2039  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0636  transcriptional activator  34.09 
 
 
423 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0172  helix-turn-helix domain-containing protein  40.74 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0665  transcriptional regulator  35.37 
 
 
425 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0514  helix-turn-helix domain-containing protein  44 
 
 
426 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
124 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0725  transcriptional activator  34.09 
 
 
419 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0510  transcriptional activator (transcriptional regulator)  32.95 
 
 
423 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.924451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4702  transcriptional activator  34.09 
 
 
419 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00084826 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0508  transcriptional activator (transcriptional regulator)  32.95 
 
 
423 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  26.87 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  29.47 
 
 
347 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0654  DNA-binding protein  34.09 
 
 
424 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000206988 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  26.32 
 
 
403 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  30.43 
 
 
404 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.32 
 
 
864 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  30.49 
 
 
190 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  25.56 
 
 
403 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>