More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2142 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  355  9.999999999999999e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  45.95 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  48.33 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  48.33 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 67 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 67 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  34.02 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  36.14 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 101 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 132 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 118 aa  52.4  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  36.14 
 
 		 361 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  37.84 
 
 		 377 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 110 aa  52  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 77 aa  52  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 111 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  25.27 
 
 		 301 aa  51.2  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 321 aa  51.2  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  33.64 
 
 		 302 aa  51.2  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 359 aa  51.2  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 105 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  35.9 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0622  transcriptional regulator, putative  38.67 
 
 		 303 aa  50.1  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.436499  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 120 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  41.56 
 
 		 421 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  38.33 
 
 		 342 aa  50.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 120 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  41.56 
 
 		 421 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 120 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0548  prophage LambdaSa1, repressor protein, putative  28.93 
 
 		 265 aa  48.9  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000127482  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 68 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  27.03 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  33.73 
 
 		 364 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 84 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 107 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 72 aa  48.5  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2087  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1852  Cro/CI family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 642 aa  48.1  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 188 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 73 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  34.92 
 
 		 123 aa  47.8  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 187 aa  47.8  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 197 aa  47.8  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  31.62 
 
 		 165 aa  47.4  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 113 aa  47.8  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 115 aa  47.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 213 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 397 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 397 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  38.24 
 
 		 308 aa  47.4  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  36.05 
 
 		 312 aa  47.4  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3208  transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  35 
 
 		 245 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.59 
 
 		 267 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 66 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  35.82 
 
 		 383 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0422  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4411  hypothetical protein  35.06 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4100  Cro/CI family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 129 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.394089  normal  0.0554933 
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  35.09 
 
 		 303 aa  46.6  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 67 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0045  PbsX family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 117 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108741  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  32.29 
 
 		 128 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  29.21 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  32.38 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 77 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  36.99 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 374 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3680  helix-turn-helix domain protein  42.62 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  32.38 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  40.85 
 
 		 347 aa  46.6  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2959  transcriptional regulator, XRE family  30.66 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676432  normal  0.753241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>