More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1221 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 173 aa  353  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1419  Cro/CI family transcriptional regulator  69.01 
 
 		 142 aa  195  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 174 aa  158  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  42.86 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 71 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 71 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 105 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  43.84 
 
 		 227 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  48.28 
 
 		 352 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  46.03 
 
 		 72 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  43.84 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  36.25 
 
 		 80 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  46.15 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 225 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06770  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 106 aa  51.6  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 110 aa  51.6  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 120 aa  51.2  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 192 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 300 aa  50.8  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 101 aa  50.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 72 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 72 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  35.94 
 
 		 75 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  36.51 
 
 		 288 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  26.92 
 
 		 308 aa  48.5  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  36.36 
 
 		 421 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 287 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  36.36 
 
 		 421 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  36.51 
 
 		 285 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  36.51 
 
 		 285 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  36.51 
 
 		 285 aa  48.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  36.51 
 
 		 285 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1019  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 107 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 219 aa  48.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  36.51 
 
 		 213 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 260 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 192 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 180 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.82 
 
 		 120 aa  47.8  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 198 aa  47.8  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  32.32 
 
 		 211 aa  47.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  36.51 
 
 		 285 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 181 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  32.98 
 
 		 198 aa  47.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 204 aa  47.4  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2292  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.183248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  36.92 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 93 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 90 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  36.51 
 
 		 285 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 490 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  33.82 
 
 		 73 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  34.92 
 
 		 285 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 86 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  38.81 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  29.81 
 
 		 490 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  39.68 
 
 		 245 aa  46.6  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 112 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  31.65 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  38.46 
 
 		 355 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  30.93 
 
 		 505 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 91 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  29.06 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  34.78 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 90 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 387 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 256 aa  45.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  31.52 
 
 		 404 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 489 aa  45.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 255 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>