59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2292 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2292  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 96 aa  191  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.183248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  47.46 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1022  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0190  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995138  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  36 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 230 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  43.55 
 
 		 255 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1419  Cro/CI family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 300 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1485  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 403 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 78 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 72 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 187 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 256 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 403 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  38.71 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5730  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 239 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  41.67 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2821  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0738374  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  34.78 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  43.75 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0734  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 60 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  33.33 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 76 aa  40.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  33.33 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  33.33 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 69 aa  40  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 403 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0554  prophage LambdaSa1, Cro/CI family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.5 
 
 		 189 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 189 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>