165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0650 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 110 aa  220  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1462  transcriptional regulator, XRE family  33.64 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1263  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197496  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 128 aa  50.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  35.96 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6541  XRE family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2824  XRE family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  36.76 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1900  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.43236e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2292  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.183248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  41.27 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1419  Cro/CI family transcriptional regulator  45 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  46.3 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  34.02 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1745  XRE family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000375519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  31.03 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0419  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  50 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000322985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0433  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  50 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000382522  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  35.38 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  31.76 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0826  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000131659  unclonable  0.000000470251 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  29.52 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 253 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1022  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  51.28 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  34.02 
 
 		 223 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 252 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0041  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0601255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0269  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.75294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.89 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  52.78 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4784  transcriptional regulator, XRE family  52.38 
 
 		 182 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6155  hypothetical protein  32.39 
 
 		 225 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  hitchhiker  0.000659717 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3842  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.039108 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  32.94 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  55.26 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  55.26 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  55.26 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  37.93 
 
 		 355 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.69 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  31.76 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  32.86 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  37.29 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 497 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2342  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 279 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000474992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3236  transcriptional regulator, XRE family  34 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  37.1 
 
 		 98 aa  42.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1320  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 98 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  31.76 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0063  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  38.71 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  39.06 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  37.1 
 
 		 436 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  35.29 
 
 		 376 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  31.76 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  30.3 
 
 		 348 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1297  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  40.68 
 
 		 347 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  34.12 
 
 		 505 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 263 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  40.32 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1144  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 266 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4568  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0923451  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 804 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2319  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 228 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288377  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1422  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 652 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 71 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>