More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0921 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0442  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  186  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00012012  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 117 aa  84.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  41.59 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3294  XRE family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.600359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.02 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2922  XRE family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.02 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  45.31 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06770  predicted transcriptional regulator  40.98 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  30.25 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  42.19 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  29.29 
 
 		 364 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  40.3 
 
 		 436 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  41.94 
 
 		 210 aa  52.4  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 374 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 346 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  33.82 
 
 		 374 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 374 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  34.33 
 
 		 374 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 199 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  33.82 
 
 		 374 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 374 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  33.82 
 
 		 374 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 374 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  33.82 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 374 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 212 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  33.82 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 334 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  34.85 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  37.04 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 361 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 273 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  28.7 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0134  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 276 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  37.35 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  28.99 
 
 		 262 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 242 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0422  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  31.58 
 
 		 229 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 201 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  31.58 
 
 		 229 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 395 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  28.99 
 
 		 262 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 262 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  38.1 
 
 		 227 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 262 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  34.72 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 368 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  34.83 
 
 		 253 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1248  helix-turn-helix domain protein  41.27 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000139831  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  30.99 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5917  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.23 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  28.18 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 513 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 359 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 370 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  32.79 
 
 		 206 aa  46.2  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  36.67 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1091  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1190  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  35.94 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  35.71 
 
 		 263 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  32.1 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5087  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000142264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 252 aa  45.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 380 aa  45.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1248  DNA-binding protein  27.62 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.821781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>