230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0422 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0422  transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  33.09 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  33.57 
 
 		 141 aa  83.6  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  35.25 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  41.77 
 
 		 321 aa  52  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 403 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 404 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 403 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 403 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 403 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 403 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2087  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 195 aa  51.2  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 403 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  38.03 
 
 		 403 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6164  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  38.03 
 
 		 404 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  38.1 
 
 		 308 aa  48.1  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 211 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  39.02 
 
 		 302 aa  47.8  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 210 aa  47.8  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 231 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 203 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 175 aa  47  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3217  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  32.99 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931444 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 248 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  36.51 
 
 		 200 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 260 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0731  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  32.76 
 
 		 315 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  48.21 
 
 		 207 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  33.9 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0885  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 404 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 176 aa  44.3  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3896  transcriptional regulator, XRE family  49.15 
 
 		 73 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.262304 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2190  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 222 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1876  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 197 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  25.19 
 
 		 505 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 259 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  26.85 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  37.7 
 
 		 227 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6372  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0301  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3493  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 197 aa  43.5  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2245  Cro/CI family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 197 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.683994 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 224 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 223 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 84 aa  42.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  39.24 
 
 		 303 aa  43.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4093  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 244 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2066  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  31.2 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1585  transcriptional regulator, XRE family  26.61 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.772364  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4267  XRE family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043882  hitchhiker  0.0000172239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4413  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.465238  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1039  hypothetical protein  38.27 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1469  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1421  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  28.57 
 
 		 327 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.141985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0893  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  28.57 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187565  normal  0.182245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2697  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  29.17 
 
 		 374 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>